286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0119 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0119  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 324 aa  620  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3037  carbohydrate kinase, YjeF related protein  63.95 
 
 		 318 aa  299  4e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.974968 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1301  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.39 
 
 		 296 aa  199  7.999999999999999e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0119511  decreased coverage  0.000369396 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3700  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.69 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.562936  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5173  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.07 
 
 		 298 aa  176  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.235734  normal  0.234925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4707  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.09 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5246  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.64 
 
 		 309 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0182  hypothetical protein  33.11 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0742  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.94 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3050  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.5 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  30.22 
 
 		 512 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.95 
 
 		 510 aa  106  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.91 
 
 		 528 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  31.65 
 
 		 498 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  30.25 
 
 		 512 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  31.61 
 
 		 493 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  31.61 
 
 		 493 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.99 
 
 		 516 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.34 
 
 		 515 aa  99.8  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.21 
 
 		 499 aa  99  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  31.19 
 
 		 517 aa  96.7  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.65 
 
 		 516 aa  96.3  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.12 
 
 		 487 aa  95.5  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  29.77 
 
 		 524 aa  93.2  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 546 aa  92.8  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.11 
 
 		 519 aa  92.4  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.08 
 
 		 517 aa  89.7  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.98 
 
 		 511 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.46 
 
 		 521 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  32.43 
 
 		 506 aa  87  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.94 
 
 		 512 aa  86.7  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  33.94 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.47 
 
 		 513 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0181  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.51 
 
 		 509 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.89 
 
 		 556 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.54 
 
 		 556 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4181  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.1 
 
 		 567 aa  82.8  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.28 
 
 		 530 aa  82.8  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1309  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.48 
 
 		 528 aa  82  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.303647  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.57 
 
 		 532 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.77 
 
 		 504 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  28.89 
 
 		 503 aa  82  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  29.58 
 
 		 515 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  29.58 
 
 		 515 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  31.19 
 
 		 504 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0510  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.77 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0209732  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  31.19 
 
 		 504 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.58 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479254  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  24.76 
 
 		 499 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  28.25 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  29.26 
 
 		 510 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  29.26 
 
 		 515 aa  80.1  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  30.85 
 
 		 504 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.26 
 
 		 515 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  29.26 
 
 		 510 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  29.26 
 
 		 515 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  27.76 
 
 		 499 aa  79.7  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  29.26 
 
 		 515 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  29.97 
 
 		 522 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  25.16 
 
 		 499 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.76 
 
 		 494 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.28 
 
 		 286 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.35 
 
 		 513 aa  79  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.28 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.686463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  28.67 
 
 		 514 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  28.08 
 
 		 514 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.7 
 
 		 518 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.11 
 
 		 494 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  28.67 
 
 		 514 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  28.67 
 
 		 514 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  28.67 
 
 		 514 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.93 
 
 		 533 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  27.53 
 
 		 524 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.79 
 
 		 512 aa  77.8  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000105274  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.45 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  30.03 
 
 		 514 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.89 
 
 		 519 aa  76.6  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  29.39 
 
 		 510 aa  76.6  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.77 
 
 		 514 aa  75.9  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.77 
 
 		 501 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.105421  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.36 
 
 		 496 aa  75.1  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.29 
 
 		 492 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.48 
 
 		 499 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.13 
 
 		 494 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.86 
 
 		 512 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4690  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.46 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.993931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.99 
 
 		 500 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  23.84 
 
 		 492 aa  74.7  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  27.18 
 
 		 490 aa  75.1  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  34 
 
 		 530 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.41 
 
 		 501 aa  74.7  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.25 
 
 		 490 aa  74.3  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0491  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.89 
 
 		 504 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0936655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.25 
 
 		 524 aa  74.3  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  34.36 
 
 		 496 aa  73.9  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  30.1 
 
 		 492 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.86 
 
 		 490 aa  73.2  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  30.82 
 
 		 499 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.99 
 
 		 498 aa  72.8  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.62 
 
 		 499 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>