More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1090 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1090  YjeF-related protein-like  100 
 
 
526 aa  1042    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.393825  normal  0.597478 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1309  carbohydrate kinase, YjeF related protein  58.51 
 
 
528 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.303647  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1020  YjeF-related protein-like  57.71 
 
 
525 aa  567  1e-160  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0522551  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1272  carbohydrate kinase, YjeF related protein  55.81 
 
 
530 aa  560  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0216258 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1264  carbohydrate kinase, YjeF related protein  54.27 
 
 
527 aa  545  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1204  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.14 
 
 
523 aa  509  1e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128075  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0995  carbohydrate kinase, YjeF related protein  53.86 
 
 
531 aa  510  1e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.59 
 
 
510 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.24 
 
 
519 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.74 
 
 
517 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  36.31 
 
 
514 aa  238  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  34.69 
 
 
517 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.28 
 
 
516 aa  232  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.2 
 
 
528 aa  230  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.65 
 
 
509 aa  230  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.43 
 
 
513 aa  229  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 
533 aa  228  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.38 
 
 
525 aa  228  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.08 
 
 
521 aa  225  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.65 
 
 
515 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.69 
 
 
514 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.51 
 
 
520 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  35.49 
 
 
519 aa  219  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.01 
 
 
492 aa  218  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  34.9 
 
 
530 aa  216  5.9999999999999996e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.78 
 
 
524 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.72 
 
 
532 aa  208  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.27 
 
 
533 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.64 
 
 
524 aa  207  5e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  29.79 
 
 
499 aa  206  7e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  30.02 
 
 
499 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.27 
 
 
521 aa  205  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.9 
 
 
521 aa  204  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.71 
 
 
506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.23 
 
 
530 aa  201  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  34.72 
 
 
512 aa  199  9e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.52 
 
 
504 aa  199  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.16 
 
 
524 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.95 
 
 
500 aa  193  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  33.08 
 
 
499 aa  193  6e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.46 
 
 
500 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  30.39 
 
 
524 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.27 
 
 
512 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.15 
 
 
519 aa  190  5.999999999999999e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  33.7 
 
 
512 aa  189  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  34.23 
 
 
522 aa  189  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.39 
 
 
524 aa  188  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.74 
 
 
499 aa  189  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.77 
 
 
498 aa  187  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  31.1 
 
 
498 aa  186  7e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.08 
 
 
499 aa  186  7e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.14 
 
 
499 aa  186  7e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.38 
 
 
501 aa  183  7e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.55 
 
 
518 aa  182  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.58 
 
 
490 aa  181  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.14 
 
 
499 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.43 
 
 
494 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.01 
 
 
514 aa  178  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.75 
 
 
494 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.43 
 
 
533 aa  177  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  33.78 
 
 
506 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.43 
 
 
494 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.6 
 
 
492 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.76 
 
 
511 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  29.62 
 
 
499 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  30.26 
 
 
514 aa  174  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.04 
 
 
494 aa  174  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.6 
 
 
516 aa  172  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  30.26 
 
 
504 aa  172  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.95 
 
 
513 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.9 
 
 
507 aa  171  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  30.37 
 
 
496 aa  172  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.27 
 
 
514 aa  172  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  30.48 
 
 
510 aa  171  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  30.26 
 
 
504 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  30.26 
 
 
504 aa  171  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  31.97 
 
 
492 aa  170  8e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.51 
 
 
515 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  31.51 
 
 
510 aa  168  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.3 
 
 
542 aa  168  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.7 
 
 
504 aa  168  2e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.63 
 
 
499 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  31.29 
 
 
515 aa  167  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  30.52 
 
 
492 aa  167  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  29.78 
 
 
513 aa  167  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.9 
 
 
493 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  31.29 
 
 
510 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  29.66 
 
 
510 aa  166  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.9 
 
 
497 aa  166  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.95 
 
 
501 aa  166  9e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  31.29 
 
 
515 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  31.29 
 
 
515 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  31.29 
 
 
515 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  29.43 
 
 
503 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  31.29 
 
 
515 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.81 
 
 
499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.22 
 
 
494 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  32.39 
 
 
514 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  32.39 
 
 
514 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  32.39 
 
 
514 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>