More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4206 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4206  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 293 aa  578  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  43.03 
 
 		 308 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  35.86 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  38.78 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  34.23 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 		 248 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  35.67 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 260 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2199  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  36.32 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.745324  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 272 aa  108  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  36.05 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  34.88 
 
 		 252 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  31.03 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  33.61 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0297  IclR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  34.31 
 
 		 253 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 		 265 aa  102  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  37.32 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  37.32 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  33.33 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  29.48 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  30.37 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  32.38 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 269 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  37.41 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 275 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 254 aa  99.8  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  30.91 
 
 		 263 aa  99.8  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  32.91 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 291 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  32.64 
 
 		 273 aa  99.4  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  32.82 
 
 		 253 aa  99  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 260 aa  99  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  31.58 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.58 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  32.06 
 
 		 263 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  32.06 
 
 		 263 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2006  IclR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 274 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  36.6 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  32.06 
 
 		 263 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  32.06 
 
 		 263 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  32.06 
 
 		 263 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  33.98 
 
 		 277 aa  96.3  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  35.35 
 
 		 281 aa  96.3  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  34.96 
 
 		 257 aa  96.3  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.36 
 
 		 263 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  31.36 
 
 		 263 aa  95.9  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 263 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  31.36 
 
 		 263 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  35.47 
 
 		 265 aa  95.9  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  31.36 
 
 		 263 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  31.36 
 
 		 263 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.97 
 
 		 259 aa  95.9  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  31.36 
 
 		 263 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 267 aa  95.9  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 258 aa  95.5  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  30.66 
 
 		 254 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4529  IclR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 273 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143169 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  34.45 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  31.36 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  30.45 
 
 		 263 aa  95.5  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  31.58 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3621  transcriptional regulator, IclR family  37.93 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  27.89 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  29.76 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 256 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0484  IclR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0371471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  29.85 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  30.91 
 
 		 263 aa  94  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  31.14 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  31.58 
 
 		 280 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 280 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 264 aa  93.6  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 284 aa  92.8  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 252 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 260 aa  92.8  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 283 aa  92.4  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  33.02 
 
 		 281 aa  92.4  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  36.46 
 
 		 267 aa  92.4  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 263 aa  92.4  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  33.17 
 
 		 254 aa  92  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2092  transcriptional regulator, IclR family  30.86 
 
 		 270 aa  92  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321928 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  27.49 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4436  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 		 261 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  38.18 
 
 		 270 aa  92  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6800  transcriptional regulator, IclR family  30.98 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  30.62 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0906  regulatory proteins, IclR  30.52 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 268 aa  90.9  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  30.97 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.34 
 
 		 280 aa  90.1  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>