175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0665 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0665  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 		 256 aa  498  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0691  flagellar biosynthesis protein FliR  93.75 
 
 		 256 aa  471  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  93.75 
 
 		 256 aa  471  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0700656  normal  0.100777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6516  flagellar biosynthesis protein FliR  63.56 
 
 		 256 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1699  flagellar biosynthesis protein FliR  55.92 
 
 		 248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3589  flagellar biosynthesis protein FliR  42.56 
 
 		 251 aa  202  6e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0050  type III secretion system inner membrane R protein  40.56 
 
 		 249 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1119  flagellar biosynthesis protein FliR  45.19 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294704  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0271  flagellar biosynthesis protein FliR  42.26 
 
 		 248 aa  176  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130948  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4185  flagellar biosynthesis protein FliR  38.37 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  38.37 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1159  flagellar biosynthesis protein FliR  39.58 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  35.95 
 
 		 250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0346  flagellar biosynthesis protein FliR  38.43 
 
 		 250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233596  normal  0.715402 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  36.02 
 
 		 250 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0378  flagellar biosynthesis protein FliR  38.2 
 
 		 250 aa  158  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1036  flagellar biosynthesis protein FliR  39.34 
 
 		 239 aa  156  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  24.8 
 
 		 255 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4187  flagellar biosynthetic protein FliR  31.34 
 
 		 256 aa  95.1  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  26.03 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  31.56 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  28.39 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  26.48 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  23.11 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  28.02 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  26.15 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  28.93 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  30.59 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  31.28 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  25.2 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  28.96 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2980  type III secretion system inner membrane R protein  30.6 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1321  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  30.6 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2612  type III secretion system inner membrane R protein  27.71 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  27.39 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  26.11 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2954  flagellar biosynthetic protein FliR  28.51 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  24.88 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  24.46 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  26.98 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  29.52 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  28.07 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  28.07 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  28.07 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  28.07 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  27.63 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  27.88 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  27.63 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  27.63 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  27.12 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  27.63 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  26.53 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  28.24 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  26.64 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  27.4 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  27.35 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  24.3 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  26.86 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  25.2 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  27.01 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  26.97 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3257  flagellar biosynthesis protein FliR  25.78 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  21.54 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  28.14 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  25.22 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  25.88 
 
 		 262 aa  62  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0215  flagellar biosynthetic protein FliR  28.51 
 
 		 260 aa  62  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  28.96 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3035  flagellar biosynthesis protein FliR  27.12 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2627  flagellar biosynthetic protein FliR  27.45 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  24.78 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31040  flagellar biosynthetic protein FliR  25 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  25.99 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  22.65 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  26.64 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  27.14 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  25.33 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  24.76 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  25.12 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  23.56 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  23.08 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  27.15 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  24.88 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  24.14 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  24 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  23.7 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  25.58 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  24.77 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  22.59 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  24.23 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  23.22 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  25.33 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  25 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1703  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2130  type III secretion system inner membrane R protein  24.34 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  25.66 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0042  type III secretion system inner membrane R protein  27 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  25.69 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  26.14 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  25.71 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>