101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1099 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 
72 aa  149  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  80 
 
 
78 aa  94.7  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3101  hypothetical protein  66.07 
 
 
56 aa  79  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.031062  normal  0.0887922 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  59.26 
 
 
75 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  56.14 
 
 
68 aa  67  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  63.83 
 
 
72 aa  66.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  50.88 
 
 
68 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  50.88 
 
 
68 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  44.62 
 
 
74 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 
72 aa  62  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  60 
 
 
78 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  59.26 
 
 
72 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  59.26 
 
 
72 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  38.89 
 
 
74 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  49.06 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  48.15 
 
 
72 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  48.15 
 
 
72 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  52.83 
 
 
74 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  49.12 
 
 
71 aa  57  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  56.82 
 
 
68 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1234  protein of unknown function UPF0150  52.08 
 
 
66 aa  57  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  56.82 
 
 
68 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  46.43 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  48.21 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  50.94 
 
 
74 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  48.21 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  45.28 
 
 
72 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  48.21 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  47.17 
 
 
87 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  45.61 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  46.3 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1241  hypothetical protein  54.55 
 
 
55 aa  53.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  41.82 
 
 
80 aa  52  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  40.74 
 
 
72 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  50 
 
 
72 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  38.57 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  43.86 
 
 
137 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  42.59 
 
 
75 aa  52  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0021  hypothetical protein  49.06 
 
 
72 aa  50.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.317209  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  46.3 
 
 
70 aa  50.4  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0483  hypothetical protein  45.65 
 
 
73 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.243945  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  41.82 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  54.76 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  42.42 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  44.23 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1541  hypothetical protein  53.85 
 
 
56 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  42.42 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  41.82 
 
 
74 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  46 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0210  protein of unknown function UPF0150  46.81 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0206  protein of unknown function UPF0150  46.81 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139417 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0712  hypothetical protein  48.84 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1176  protein of unknown function UPF0150  40.82 
 
 
69 aa  47.8  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4509  protein of unknown function UPF0150  45.83 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  38.33 
 
 
75 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  38.24 
 
 
70 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0001  protein of unknown function UPF0150  45.83 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  43.75 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4580  hypothetical protein  42.59 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.520083  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0717  hypothetical protein  48.84 
 
 
57 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  51.06 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  38.6 
 
 
68 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  34.72 
 
 
78 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0443  protein of unknown function UPF0150  42.59 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0276188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0248  hypothetical protein  43.48 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.209106  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  44.9 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  39.29 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  42.11 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  40.38 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  41.94 
 
 
69 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  42.22 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3688  hypothetical protein  42.22 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148975  hitchhiker  0.00946321 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2648  hypothetical protein  53.66 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1442  hypothetical protein  48.94 
 
 
68 aa  44.3  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1149  hypothetical protein  38.64 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2553  hypothetical protein  50 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0369521  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1108  hypothetical protein  39.66 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  43.08 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  47.5 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1096  hypothetical protein  40 
 
 
48 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.497626  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0554  hypothetical protein  40.91 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  38.18 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2115  hypothetical protein  43.1 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.592477  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  45.45 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  37.74 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  40.38 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  43.18 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  43.18 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  40.38 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  46.67 
 
 
137 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  37.5 
 
 
132 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  38.3 
 
 
135 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  42.31 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  43.18 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  43.64 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  40.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  36.36 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  42 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  43.75 
 
 
86 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>