232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4301 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1523  TonB-dependent receptor  43.11 
 
 
1045 aa  803    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4301  TonB-dependent receptor  100 
 
 
1018 aa  2101    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.15211 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2186  TonB-dependent receptor  46.25 
 
 
1040 aa  904    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.996858  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2679  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 
1054 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5620  putative extracellular heme-binding protein  29.94 
 
 
930 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64710  putative extracellular heme-binding protein  29.26 
 
 
989 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.572363  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 
973 aa  368  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2303  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 
982 aa  350  8e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243733  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.92 
 
 
1186 aa  228  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3189  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 
728 aa  148  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0566  heme receptor HasR  27.99 
 
 
784 aa  140  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1720  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  25.6 
 
 
885 aa  114  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20010  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  25.26 
 
 
891 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0486368  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1411  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.14 
 
 
892 aa  108  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  27.94 
 
 
861 aa  100  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.38 
 
 
862 aa  98.2  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2389  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 
823 aa  96.7  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.687523  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27 
 
 
862 aa  95.1  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.18 
 
 
849 aa  93.2  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.24 
 
 
862 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1814  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.35 
 
 
892 aa  93.2  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.08 
 
 
867 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.69 
 
 
859 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 
799 aa  87  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  30.62 
 
 
799 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 
799 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  27.05 
 
 
857 aa  82  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  32.51 
 
 
669 aa  80.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  27.2 
 
 
851 aa  79.7  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  27.2 
 
 
851 aa  79  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 
794 aa  78.2  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  26.26 
 
 
828 aa  78.2  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 
806 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  26.12 
 
 
797 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  25 
 
 
820 aa  77  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  32.12 
 
 
685 aa  76.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  23.73 
 
 
828 aa  75.5  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  42.31 
 
 
808 aa  75.5  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.42 
 
 
759 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  44.34 
 
 
814 aa  73.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0130  TonB-dependent heme receptor HasR  22.47 
 
 
830 aa  72.4  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  34.88 
 
 
793 aa  72  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  25.58 
 
 
784 aa  71.6  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  34.65 
 
 
717 aa  71.2  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  27.34 
 
 
774 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  27.34 
 
 
774 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  26.99 
 
 
774 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  36.84 
 
 
822 aa  70.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  36.07 
 
 
817 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  34.38 
 
 
743 aa  70.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  29.71 
 
 
812 aa  70.1  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  32.5 
 
 
828 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4086  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.74 
 
 
783 aa  70.1  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3894  TonB-dependent heme receptor HasR  22.74 
 
 
830 aa  70.1  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  23.39 
 
 
828 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  32.52 
 
 
764 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  32.52 
 
 
764 aa  69.7  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 
774 aa  69.3  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  26.93 
 
 
693 aa  69.3  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 
811 aa  68.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  35.66 
 
 
795 aa  67.8  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  29.26 
 
 
774 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  29.95 
 
 
774 aa  67.8  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0181  TonB-dependent outer membrane receptor  33.06 
 
 
915 aa  67.4  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  28.47 
 
 
712 aa  66.6  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 
801 aa  67  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.06 
 
 
734 aa  66.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  28.72 
 
 
777 aa  65.5  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004277  TonB-dependent heme receptor  30.43 
 
 
730 aa  65.5  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  30.77 
 
 
779 aa  65.1  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  28.3 
 
 
778 aa  64.3  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 
829 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.17 
 
 
722 aa  63.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.89 
 
 
783 aa  63.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  34.35 
 
 
808 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  29.75 
 
 
789 aa  63.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  35.85 
 
 
833 aa  63.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  26.17 
 
 
782 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  31.67 
 
 
828 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  25.12 
 
 
774 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.47 
 
 
704 aa  62.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 
828 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 
810 aa  62.4  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 
799 aa  62.4  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 
810 aa  62.4  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  31.65 
 
 
827 aa  62  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 
782 aa  62  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  26.3 
 
 
784 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  23.98 
 
 
811 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  29.19 
 
 
804 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
798 aa  59.7  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  37.04 
 
 
863 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.25 
 
 
657 aa  60.1  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  30.23 
 
 
810 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0115  tonB-dependent receptor  29.84 
 
 
753 aa  59.7  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  26.35 
 
 
784 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  29.23 
 
 
778 aa  59.3  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  25.3 
 
 
802 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 
841 aa  59.3  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  44.44 
 
 
881 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>