More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0872 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0872  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 257 aa  531  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.321914 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06341  hypothetical protein  42.8 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001408  transcriptional regulator AraC/XylS family  44.36 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1247  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 269 aa  206  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1918  AraC family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 259 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0612288 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0595  AraC/XylS family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 262 aa  178  9e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3868  AraC family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0359571 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0281  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 252 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0317  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1460  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  32.93 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.133338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3973  transcriptional regulator, AraC family  31.56 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4050  helix-turn-helix domain-containing protein  31.56 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4168  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4081  helix-turn-helix domain-containing protein  31.56 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00496  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.6 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00501  hypothetical protein  25.6 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3225  transcriptional regulator, AraC family  25.6 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.778963  hitchhiker  0.00123276 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4301  transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2169  AraC family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.841955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2034  AraC family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2944  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 288 aa  82  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0636812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1953  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0209316  normal  0.951803 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1123  AraC family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.14002e-21 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1191  regulatory protein  25.31 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1145  regulatory protein  25.31 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103899  normal  0.251225 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1040  regulatory protein  25.31 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.907674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1157  AraC family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.220941  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3185  transcriptional regulator HilD  33.33 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.66129 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3080  transcriptional regulator HilD  33.33 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  hitchhiker  0.000243626 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3064  transcriptional regulator HilD  33.33 
 
 		 309 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0281413  normal  0.145015 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2997  transcriptional regulator HilD  33.33 
 
 		 309 aa  75.5  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124423  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3028  transcriptional regulator HilD  33.33 
 
 		 309 aa  75.5  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000980796  normal  0.0102842 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1698  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.757591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4563  transcriptional regulator, AraC family  28.03 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1505  AraC family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000918966  hitchhiker  0.0000679283 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2385  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2286  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2019  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3400  transcriptional regulator, AraC family  32.74 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.558312  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001523  putative AraC-type regulatory protein  27.46 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205553  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2142  transcriptional regulator, AraC family  37.08 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1854  transcriptional regulator, AraC family  37.08 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.191577  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3135  transcriptional regulator, AraC family  28.85 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07340  putative transcriptional regulator  37.21 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1604  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  32.63 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0758  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 352 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 373 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3929  putative fimbrial operon positive regulatory protein FanR  27 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.9126 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03987  DNA-binding transcriptional activator  27.66 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2593  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3876  transcriptional regulator, AraC family  27.66 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4613  transcriptional regulator AdiY  23.38 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4581  transcriptional regulator AdiY  23.38 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4670  transcriptional regulator AdiY  23.38 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5629  transcriptional regulator AdiY  23.38 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4641  porin thermoregulatory protein EnvY  25.36 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.841286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4690  porin thermoregulatory protein EnvY  25.36 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4641  porin thermoregulatory protein EnvY  27.55 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3911  AraC family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.508858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4356  transcriptional regulator AdiY  23.38 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.823091  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4550  porin thermoregulatory protein EnvY  25.36 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.578175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03948  hypothetical protein  27.66 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2406  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0741804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  31.76 
 
 		 358 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4661  AraC family regulatory protein  35.29 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4570  AraC family regulatory protein  35.29 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.132116  normal  0.374836 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5355  AraC family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 340 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.924239 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4661  AraC family regulatory protein  35.29 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  37.5 
 
 		 1334 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  31.76 
 
 		 358 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2194  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000326413  hitchhiker  0.0000000776188 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0306  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0789  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3065  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0508802  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  34.41 
 
 		 1316 aa  55.8  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0986  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.949887  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4576  AraC family regulatory protein  34.12 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 344 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 347 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4877  DNA-binding transcriptional regulator GadX  30.85 
 
 		 274 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4710  AraC family regulatory protein  34.12 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3459  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 336 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195796  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3819  DNA-binding transcriptional regulator GadX  30.85 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660589 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 		 347 aa  55.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 336 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 336 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0197  transcriptional regulator, AraC family  30.85 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3914  DNA-binding transcriptional regulator GadX  30.85 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03317  hypothetical protein  30.85 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3719  DNA-binding transcriptional regulator GadX  30.85 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.842811  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0690  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0066  AraC family transcription regulator  32.67 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0603708  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 		 304 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>