More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1191 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1145  regulatory protein  100 
 
 
262 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103899  normal  0.251225 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1040  regulatory protein  100 
 
 
262 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.907674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1123  AraC family transcriptional regulator  99.62 
 
 
262 aa  534  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  5.14002e-21 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1191  regulatory protein  100 
 
 
262 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1157  AraC family transcriptional regulator  98.47 
 
 
262 aa  530  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.220941  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2169  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 
265 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.841955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2034  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 
265 aa  156  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00496  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.99 
 
 
265 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00501  hypothetical protein  33.99 
 
 
265 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3225  transcriptional regulator, AraC family  33.99 
 
 
265 aa  155  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.778963  hitchhiker  0.00123276 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3868  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 
252 aa  129  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0359571 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0281  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
252 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0317  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.71 
 
 
252 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4050  helix-turn-helix domain-containing protein  30.68 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4168  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3973  transcriptional regulator, AraC family  30.28 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4081  helix-turn-helix domain-containing protein  30.28 
 
 
252 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2944  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0636812  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1854  transcriptional regulator, AraC family  30.31 
 
 
285 aa  106  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.191577  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2286  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 
291 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2019  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 
291 aa  102  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2385  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 
291 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2142  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 
288 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3135  transcriptional regulator, AraC family  30.57 
 
 
282 aa  97.8  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0595  AraC/XylS family transcriptional regulator  26.32 
 
 
262 aa  96.7  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1247  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
269 aa  96.3  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0986  transcriptional regulator, AraC family  33.47 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.949887  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3400  transcriptional regulator, AraC family  28.77 
 
 
274 aa  94  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.558312  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4301  transcriptional regulator, AraC family  29.57 
 
 
284 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06341  hypothetical protein  27.94 
 
 
260 aa  92  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001408  transcriptional regulator AraC/XylS family  26.51 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4563  transcriptional regulator, AraC family  29.8 
 
 
284 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1698  AraC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
222 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.757591  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1505  AraC family transcriptional regulator  39.5 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000918966  hitchhiker  0.0000679283 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1953  AraC family transcriptional regulator  38.66 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0209316  normal  0.951803 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1918  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0612288 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0872  helix-turn-helix domain-containing protein  25.31 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.321914 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1836  AraC family transcriptional regulator  38.94 
 
 
340 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03363  DNA-binding transcriptional activator  35.71 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4875  transcriptional regulator GadW  35.71 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0198  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0202  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.503691 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4001  transcriptional regulator GadW  36.04 
 
 
242 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3717  transcriptional regulator GadW  35.71 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.347301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3913  transcriptional regulator GadW  35.71 
 
 
242 aa  75.1  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3818  transcriptional regulator GadW  36.04 
 
 
242 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0200734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4661  AraC family regulatory protein  30.08 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4661  AraC family regulatory protein  30.08 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4570  AraC family regulatory protein  30.08 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.132116  normal  0.374836 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4710  AraC family regulatory protein  30.08 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238652  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4576  AraC family regulatory protein  30.08 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3527  helix-turn-helix domain-containing protein  37.17 
 
 
340 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3459  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195796  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2211  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3080  transcriptional regulator HilD  33.98 
 
 
309 aa  68.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  hitchhiker  0.000243626 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2997  transcriptional regulator HilD  35.42 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124423  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0304  putative transcription regulator  27.46 
 
 
247 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.569536 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3064  transcriptional regulator HilD  33.98 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0281413  normal  0.145015 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3028  transcriptional regulator HilD  35.42 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000980796  normal  0.0102842 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3185  transcriptional regulator HilD  34.38 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.66129 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2100  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 
382 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6507  transcriptional regulator, AraC family  36.17 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739448  normal  0.944873 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3065  transcriptional regulator, AraC family  26.4 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0508802  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4938  AraC family transcriptional regulator  35.21 
 
 
338 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289741  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3929  putative fimbrial operon positive regulatory protein FanR  26.28 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.9126 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5762  transcriptional regulator, AraC family  35.07 
 
 
337 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0052  HTH-type transcriptional regulator YdeO  31.96 
 
 
240 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2480  transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 
336 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3020  transcriptional regulator, AraC family  26.17 
 
 
295 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0395557 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2419  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 
344 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.213082 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3072  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 
295 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.879002  hitchhiker  0.00256157 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2159  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.802618  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1083  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 
356 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0148989 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1803  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 
362 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2460  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 
344 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  35.85 
 
 
337 aa  63.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2989  transcriptional regulator, AraC family  26.17 
 
 
295 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.326814  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3056  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 
295 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.106838 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2415  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 
344 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3177  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 
295 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.246411 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2325  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 
344 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001523  putative AraC-type regulatory protein  24.1 
 
 
269 aa  63.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205553  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5651  transcriptional regulator, AraC family  31.86 
 
 
345 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1460  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  21.46 
 
 
259 aa  63.5  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.133338  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4877  DNA-binding transcriptional regulator GadX  34.17 
 
 
274 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5742  AraC family transcriptional regulator  41.77 
 
 
344 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3819  DNA-binding transcriptional regulator GadX  34.17 
 
 
274 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0660589 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2147  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 
253 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.536456  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3849  helix-turn-helix, Fis-type  33 
 
 
352 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3914  DNA-binding transcriptional regulator GadX  34.17 
 
 
274 aa  62.4  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 
359 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4663  helix-turn-helix domain-containing protein  35.09 
 
 
347 aa  62.4  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.150024 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4003  DNA-binding transcriptional regulator GadX  34.17 
 
 
274 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>