More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3064 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3185  transcriptional regulator HilD  99.03 
 
 		 309 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.66129 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3028  transcriptional regulator HilD  99.68 
 
 		 309 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000980796  normal  0.0102842 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2997  transcriptional regulator HilD  99.68 
 
 		 309 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124423  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3080  transcriptional regulator HilD  99.35 
 
 		 309 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  hitchhiker  0.000243626 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3064  transcriptional regulator HilD  100 
 
 		 309 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0281413  normal  0.145015 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3056  AraC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.106838 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3177  AraC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.246411 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2989  transcriptional regulator, AraC family  36.03 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.326814  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3072  AraC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.879002  hitchhiker  0.00256157 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3020  transcriptional regulator, AraC family  36.03 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0395557 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4661  AraC family regulatory protein  35.19 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4661  AraC family regulatory protein  35.19 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4570  AraC family regulatory protein  35.19 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.132116  normal  0.374836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4576  AraC family regulatory protein  35.19 
 
 		 291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4710  AraC family regulatory protein  34.81 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238652  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2147  transcriptional regulator, AraC family  39.17 
 
 		 253 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.536456  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3065  transcriptional regulator, AraC family  42.02 
 
 		 249 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0508802  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0052  HTH-type transcriptional regulator YdeO  43.93 
 
 		 240 aa  94  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01457  predicted DNA-binding transcriptional acfivator  38.33 
 
 		 253 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1689  transcriptional regulator YdeO  38.33 
 
 		 253 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1674  transcriptional regulator YdeO  38.33 
 
 		 253 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3929  putative fimbrial operon positive regulatory protein FanR  27.27 
 
 		 276 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.9126 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2158  transcriptional regulator YdeO  38.33 
 
 		 253 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01470  hypothetical protein  38.33 
 
 		 253 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2112  transcriptional regulator YdeO  38.33 
 
 		 253 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.817957  normal  0.345974 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1584  transcriptional regulator YdeO  38.33 
 
 		 253 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.249999  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1762  transcriptional regulator YdeO  38.33 
 
 		 253 aa  93.2  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1647  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 237 aa  92  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073277  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3819  DNA-binding transcriptional regulator GadX  34.64 
 
 		 274 aa  92  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660589 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03364  DNA-binding transcriptional dual regulator  35.77 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0197  transcriptional regulator, AraC family  35.77 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4003  DNA-binding transcriptional regulator GadX  35.77 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03317  hypothetical protein  35.77 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0201  DNA-binding transcriptional regulator GadX  35.77 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3719  DNA-binding transcriptional regulator GadX  35.77 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.842811  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4877  DNA-binding transcriptional regulator GadX  35.77 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3914  DNA-binding transcriptional regulator GadX  35.77 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03363  DNA-binding transcriptional activator  40.82 
 
 		 242 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0198  transcriptional regulator, AraC family  40.82 
 
 		 242 aa  87  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0202  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 242 aa  87  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.503691 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3717  transcriptional regulator GadW  40.82 
 
 		 242 aa  87  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.347301  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4001  transcriptional regulator GadW  40.82 
 
 		 242 aa  87  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4875  transcriptional regulator GadW  40.82 
 
 		 242 aa  87  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3818  transcriptional regulator GadW  40.82 
 
 		 242 aa  87  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0200734 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3913  transcriptional regulator GadW  40.82 
 
 		 242 aa  87  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0304  putative transcription regulator  43.62 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.569536 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4641  porin thermoregulatory protein EnvY  36.29 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4690  porin thermoregulatory protein EnvY  36.29 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4550  porin thermoregulatory protein EnvY  36.29 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.578175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4641  porin thermoregulatory protein EnvY  36.29 
 
 		 253 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.841286  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03987  DNA-binding transcriptional activator  36.29 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3876  transcriptional regulator, AraC family  36.29 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4581  transcriptional regulator AdiY  36.29 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4613  transcriptional regulator AdiY  36.29 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03948  hypothetical protein  36.29 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4356  transcriptional regulator AdiY  36.29 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.823091  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5629  transcriptional regulator AdiY  36.29 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4670  transcriptional regulator AdiY  36.29 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3911  AraC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.508858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06341  hypothetical protein  36.45 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0281  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0872  helix-turn-helix domain-containing protein  26.01 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.321914 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3868  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0359571 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3063  transcriptional regulator, AraC family  35.66 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00454347  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1164  putative envelope protein encoded within prophage CP-933N  38.4 
 
 		 195 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.378647 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0317  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001408  transcriptional regulator AraC/XylS family  36.45 
 
 		 259 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0579  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 253 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0639  transcriptional regulator, AraC family  35.66 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.994132  normal  0.332523 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3086  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.790206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0583  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4168  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2194  putative transcriptional regulator  37.6 
 
 		 195 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000326413  hitchhiker  0.0000000776188 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3973  transcriptional regulator, AraC family  33.06 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4050  helix-turn-helix domain-containing protein  32.26 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4301  transcriptional regulator, AraC family  37.86 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4081  helix-turn-helix domain-containing protein  32.26 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2169  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.841955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2034  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0092  transcriptional activator of virulence loci  22.18 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2019  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2385  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2286  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1918  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0612288 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0031  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4884  hypothetical protein  25 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200087 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00496  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.98 
 
 		 265 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3225  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 265 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.778963  hitchhiker  0.00123276 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4563  transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0066  AraC family transcription regulator  31.15 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0603708  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00501  hypothetical protein  33.98 
 
 		 265 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1040  regulatory protein  35.42 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.907674  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1191  regulatory protein  35.42 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1145  regulatory protein  35.42 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103899  normal  0.251225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1157  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.220941  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1123  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.14002e-21 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0595  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2600  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2944  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0636812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3135  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>