More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0986 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0986  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 279 aa  553  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.949887  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3135  transcriptional regulator, AraC family  67.4 
 
 		 282 aa  348  7e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2944  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0636812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2019  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2286  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2385  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1157  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.220941  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1191  regulatory protein  33.61 
 
 		 262 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1040  regulatory protein  33.61 
 
 		 262 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.907674  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1145  regulatory protein  33.61 
 
 		 262 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103899  normal  0.251225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1123  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 262 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.14002e-21 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2034  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 265 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2169  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 265 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.841955  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00496  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.39 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00501  hypothetical protein  29.39 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3225  transcriptional regulator, AraC family  29.39 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.778963  hitchhiker  0.00123276 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3400  transcriptional regulator, AraC family  27.02 
 
 		 274 aa  89  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.558312  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3868  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0359571 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2142  transcriptional regulator, AraC family  26.18 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0317  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0281  AraC family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1953  AraC family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0209316  normal  0.951803 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06341  hypothetical protein  25.61 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1698  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.757591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001408  transcriptional regulator AraC/XylS family  25.91 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4301  transcriptional regulator, AraC family  32.81 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1505  AraC family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000918966  hitchhiker  0.0000679283 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1854  transcriptional regulator, AraC family  25.74 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.191577  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003334  type III secretion thermoregulatory protein (LcrF,VirF,transcription regulation of virulence plasmid)  26.29 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4563  transcriptional regulator, AraC family  32.81 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3973  transcriptional regulator, AraC family  25.76 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4168  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4050  helix-turn-helix domain-containing protein  25.76 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0595  AraC/XylS family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4081  helix-turn-helix domain-containing protein  25.33 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5651  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3929  putative fimbrial operon positive regulatory protein FanR  28.43 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.9126 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1083  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0148989 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4356  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 366 aa  65.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01697  hypothetical protein  26.07 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  39.58 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0304  putative transcription regulator  36.96 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.569536 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3849  helix-turn-helix, Fis-type  36.45 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0872  helix-turn-helix domain-containing protein  31.73 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.321914 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3046  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1460  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  26.92 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.133338  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3065  transcriptional regulator, AraC family  27.56 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0508802  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2147  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 253 aa  62  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.536456  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3064  transcriptional regulator HilD  28.3 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0281413  normal  0.145015 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001523  putative AraC-type regulatory protein  28.04 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205553  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3080  transcriptional regulator HilD  28.3 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  hitchhiker  0.000243626 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2100  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 247 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3028  transcriptional regulator HilD  28.3 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000980796  normal  0.0102842 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2997  transcriptional regulator HilD  28.3 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124423  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3072  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.879002  hitchhiker  0.00256157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0914  transcriptional regulator, AraC family  23.32 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal  0.0677642 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3185  transcriptional regulator HilD  28.3 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.66129 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3056  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.106838 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2766  transcriptional regulator, AraC family  35.83 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2989  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.326814  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3177  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.246411 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3020  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0395557 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4594  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.359709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4661  AraC family regulatory protein  29.03 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4570  AraC family regulatory protein  29.03 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.132116  normal  0.374836 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4661  AraC family regulatory protein  29.03 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4576  AraC family regulatory protein  29.03 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0308  transcriptional regulator, AraC family  30.92 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4710  AraC family regulatory protein  29.03 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0301  transcriptional regulator, AraC family  32.06 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16600  transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2141  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.755831  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3149  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0282952  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5752  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3459  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 336 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195796  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0747  transcriptional regulator, AraC family  46.75 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40849  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2005  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2271  transcriptional regulator, AraC family  26.4 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01457  predicted DNA-binding transcriptional acfivator  30.47 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1584  transcriptional regulator YdeO  30.47 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.249999  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1689  transcriptional regulator YdeO  30.47 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3152  transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0294751  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1674  transcriptional regulator YdeO  30.47 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2412  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.462091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1762  transcriptional regulator YdeO  30.47 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2158  transcriptional regulator YdeO  30.47 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01470  hypothetical protein  30.47 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  30.58 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>