More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4710 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4710  AraC family regulatory protein  100 
 
 		 291 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4576  AraC family regulatory protein  99.66 
 
 		 291 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4661  AraC family regulatory protein  99.31 
 
 		 291 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4570  AraC family regulatory protein  99.31 
 
 		 291 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.132116  normal  0.374836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4661  AraC family regulatory protein  99.31 
 
 		 291 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3056  AraC family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.106838 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3072  AraC family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.879002  hitchhiker  0.00256157 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2989  transcriptional regulator, AraC family  38.08 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.326814  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3177  AraC family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.246411 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3020  transcriptional regulator, AraC family  38.08 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0395557 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3064  transcriptional regulator HilD  34.81 
 
 		 309 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0281413  normal  0.145015 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2997  transcriptional regulator HilD  34.81 
 
 		 309 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124423  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3028  transcriptional regulator HilD  34.81 
 
 		 309 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000980796  normal  0.0102842 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3185  transcriptional regulator HilD  34.44 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.66129 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3080  transcriptional regulator HilD  34.96 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  hitchhiker  0.000243626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4877  DNA-binding transcriptional regulator GadX  30.36 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3914  DNA-binding transcriptional regulator GadX  30.36 
 
 		 274 aa  97.4  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4003  DNA-binding transcriptional regulator GadX  30.36 
 
 		 274 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3929  putative fimbrial operon positive regulatory protein FanR  27.8 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.9126 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1647  AraC family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 237 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073277  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0304  putative transcription regulator  44.92 
 
 		 247 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.569536 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03364  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.2 
 
 		 274 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03317  hypothetical protein  30.2 
 
 		 274 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0197  transcriptional regulator, AraC family  30.2 
 
 		 274 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3719  DNA-binding transcriptional regulator GadX  30.2 
 
 		 274 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.842811  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0201  DNA-binding transcriptional regulator GadX  30.2 
 
 		 274 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0052  HTH-type transcriptional regulator YdeO  43.43 
 
 		 240 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3819  DNA-binding transcriptional regulator GadX  29.8 
 
 		 274 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660589 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3065  transcriptional regulator, AraC family  37.42 
 
 		 249 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0508802  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2112  transcriptional regulator YdeO  41.44 
 
 		 253 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.817957  normal  0.345974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1674  transcriptional regulator YdeO  41.44 
 
 		 253 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1689  transcriptional regulator YdeO  45.26 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01457  predicted DNA-binding transcriptional acfivator  45.26 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1762  transcriptional regulator YdeO  45.26 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2158  transcriptional regulator YdeO  45.26 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1584  transcriptional regulator YdeO  45.26 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.249999  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01470  hypothetical protein  45.26 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2147  transcriptional regulator, AraC family  45.26 
 
 		 253 aa  89  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.536456  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4641  porin thermoregulatory protein EnvY  30.95 
 
 		 243 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4641  porin thermoregulatory protein EnvY  30.95 
 
 		 253 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.841286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4550  porin thermoregulatory protein EnvY  30.95 
 
 		 243 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.578175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4690  porin thermoregulatory protein EnvY  30.95 
 
 		 243 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4581  transcriptional regulator AdiY  33.13 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4356  transcriptional regulator AdiY  33.13 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.823091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4670  transcriptional regulator AdiY  33.13 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4613  transcriptional regulator AdiY  33.13 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3911  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.508858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5629  transcriptional regulator AdiY  33.13 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0579  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03987  DNA-binding transcriptional activator  33.13 
 
 		 253 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3063  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 253 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00454347  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3876  transcriptional regulator, AraC family  33.13 
 
 		 253 aa  87  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0639  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 253 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.994132  normal  0.332523 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3086  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 253 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.790206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03948  hypothetical protein  33.13 
 
 		 253 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0583  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 253 aa  87  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0066  AraC family transcription regulator  36.63 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0603708  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0031  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03363  DNA-binding transcriptional activator  35.59 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0198  transcriptional regulator, AraC family  35.59 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3717  transcriptional regulator GadW  35.59 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.347301  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4001  transcriptional regulator GadW  35.59 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0202  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.503691 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3913  transcriptional regulator GadW  35.59 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4875  transcriptional regulator GadW  35.59 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3818  transcriptional regulator GadW  35.59 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0200734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4884  hypothetical protein  41.57 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0281  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3868  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0359571 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0317  AraC/XylS family transcriptional regulator  34 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1157  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.220941  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3973  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4168  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1191  regulatory protein  30.08 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1040  regulatory protein  30.08 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.907674  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1145  regulatory protein  30.08 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103899  normal  0.251225 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4301  transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1123  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.14002e-21 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4050  helix-turn-helix domain-containing protein  21.96 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4081  helix-turn-helix domain-containing protein  32.67 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0092  transcriptional activator of virulence loci  25.62 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001408  transcriptional regulator AraC/XylS family  42.5 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06341  hypothetical protein  39.51 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4563  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1698  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.757591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1164  putative envelope protein encoded within prophage CP-933N  32.35 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.378647 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1953  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0209316  normal  0.951803 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2194  putative transcriptional regulator  37.17 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000326413  hitchhiker  0.0000000776188 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001523  putative AraC-type regulatory protein  32.14 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205553  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0654  HTH-type regulatory protein, AraC family  28.67 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  25.49 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0363  TCP pilus virulence regulatory protein  33.66 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.93807  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2944  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0636812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2019  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2286  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2034  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2385  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2169  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.841955  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1497  helix-turn-helix domain-containing protein  32.99 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.956503  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>