More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A3717 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03363  DNA-binding transcriptional activator  100 
 
 
242 aa  500  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0198  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
242 aa  500  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4875  transcriptional regulator GadW  100 
 
 
242 aa  500  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0202  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
242 aa  500  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.503691 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3913  transcriptional regulator GadW  99.17 
 
 
242 aa  496  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3717  transcriptional regulator GadW  100 
 
 
242 aa  500  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.347301  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4001  transcriptional regulator GadW  98.76 
 
 
242 aa  494  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3818  transcriptional regulator GadW  97.11 
 
 
242 aa  487  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0200734 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3065  transcriptional regulator, AraC family  35.68 
 
 
249 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0508802  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0304  putative transcription regulator  33.47 
 
 
247 aa  142  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.569536 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1647  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 
237 aa  141  8e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073277  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2112  transcriptional regulator YdeO  34.18 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.817957  normal  0.345974 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1689  transcriptional regulator YdeO  34.18 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1674  transcriptional regulator YdeO  34.18 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0052  HTH-type transcriptional regulator YdeO  36.02 
 
 
240 aa  133  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01457  predicted DNA-binding transcriptional acfivator  34.18 
 
 
253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1762  transcriptional regulator YdeO  34.18 
 
 
253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1584  transcriptional regulator YdeO  34.18 
 
 
253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.249999  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01470  hypothetical protein  34.18 
 
 
253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2158  transcriptional regulator YdeO  34.18 
 
 
253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2147  transcriptional regulator, AraC family  34.18 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.536456  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2194  putative transcriptional regulator  36.07 
 
 
195 aa  109  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000326413  hitchhiker  0.0000000776188 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1164  putative envelope protein encoded within prophage CP-933N  37.1 
 
 
195 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.378647 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03364  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.54 
 
 
274 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0197  transcriptional regulator, AraC family  32.54 
 
 
274 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0201  DNA-binding transcriptional regulator GadX  32.54 
 
 
274 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3719  DNA-binding transcriptional regulator GadX  32.54 
 
 
274 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.842811  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03317  hypothetical protein  32.54 
 
 
274 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3819  DNA-binding transcriptional regulator GadX  38.58 
 
 
274 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0660589 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4003  DNA-binding transcriptional regulator GadX  38.28 
 
 
274 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3914  DNA-binding transcriptional regulator GadX  38.28 
 
 
274 aa  90.9  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4877  DNA-binding transcriptional regulator GadX  38.28 
 
 
274 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0066  AraC family transcription regulator  29.39 
 
 
265 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0603708  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4641  porin thermoregulatory protein EnvY  40.16 
 
 
253 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.841286  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4550  porin thermoregulatory protein EnvY  40.16 
 
 
243 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.578175  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4641  porin thermoregulatory protein EnvY  40.16 
 
 
243 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4690  porin thermoregulatory protein EnvY  40.16 
 
 
243 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3028  transcriptional regulator HilD  40.82 
 
 
309 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000980796  normal  0.0102842 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3185  transcriptional regulator HilD  40.82 
 
 
309 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.66129 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3080  transcriptional regulator HilD  40.82 
 
 
309 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  hitchhiker  0.000243626 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2997  transcriptional regulator HilD  40.82 
 
 
309 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124423  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3064  transcriptional regulator HilD  40.82 
 
 
309 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0281413  normal  0.145015 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03987  DNA-binding transcriptional activator  37.59 
 
 
253 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3876  transcriptional regulator, AraC family  37.59 
 
 
253 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03948  hypothetical protein  37.59 
 
 
253 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5629  transcriptional regulator AdiY  37.59 
 
 
253 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4356  transcriptional regulator AdiY  37.59 
 
 
253 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.823091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4613  transcriptional regulator AdiY  37.59 
 
 
253 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4670  transcriptional regulator AdiY  37.59 
 
 
253 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4581  transcriptional regulator AdiY  37.59 
 
 
253 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3911  AraC family transcriptional regulator  37.59 
 
 
253 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.508858  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3929  putative fimbrial operon positive regulatory protein FanR  35.83 
 
 
276 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.9126 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0579  AraC family transcriptional regulator  41.13 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3063  transcriptional regulator, AraC family  41.13 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00454347  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0639  transcriptional regulator, AraC family  41.13 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.994132  normal  0.332523 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3086  AraC family transcriptional regulator  41.13 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.790206  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0583  AraC family transcriptional regulator  41.13 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4661  AraC family regulatory protein  36.44 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4570  AraC family regulatory protein  36.44 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.132116  normal  0.374836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4661  AraC family regulatory protein  36.44 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4884  hypothetical protein  39.34 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200087 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0031  AraC family transcriptional regulator  36.5 
 
 
209 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4576  AraC family regulatory protein  35.59 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4710  AraC family regulatory protein  35.59 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238652  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0092  transcriptional activator of virulence loci  37.61 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1191  regulatory protein  35.71 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1145  regulatory protein  35.71 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103899  normal  0.251225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1123  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  5.14002e-21 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1157  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.220941  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1040  regulatory protein  35.71 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.907674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3072  AraC family transcriptional regulator  30.9 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.879002  hitchhiker  0.00256157 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2989  transcriptional regulator, AraC family  30.9 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.326814  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3056  AraC family transcriptional regulator  30.9 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.106838 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3177  AraC family transcriptional regulator  30.9 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.246411 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3020  transcriptional regulator, AraC family  30.9 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0395557 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2286  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2385  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2019  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1505  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000918966  hitchhiker  0.0000679283 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1953  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0209316  normal  0.951803 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2944  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0636812  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1698  AraC family transcriptional regulator  26.53 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.757591  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
343 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 
343 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  39.24 
 
 
373 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 
364 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  39.24 
 
 
352 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0363  TCP pilus virulence regulatory protein  22.97 
 
 
276 aa  62.8  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.93807  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  33.02 
 
 
338 aa  62  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4301  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 
284 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4563  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 
284 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4050  helix-turn-helix domain-containing protein  28.69 
 
 
252 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4375  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 
345 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3400  transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 
274 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.558312  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2068  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 
339 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 
330 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4168  AraC family transcriptional regulator  27.87 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3973  transcriptional regulator, AraC family  27.87 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7688  transcriptional regulatory protein  33.33 
 
 
338 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.636938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4081  helix-turn-helix domain-containing protein  27.87 
 
 
252 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>