More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_E0052 on replicon NC_009790
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009790  EcE24377A_E0052  HTH-type transcriptional regulator YdeO  100 
 
 		 240 aa  490  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2112  transcriptional regulator YdeO  36.05 
 
 		 253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.817957  normal  0.345974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1674  transcriptional regulator YdeO  36.05 
 
 		 253 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1689  transcriptional regulator YdeO  36.05 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01457  predicted DNA-binding transcriptional acfivator  35.62 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1762  transcriptional regulator YdeO  35.62 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01470  hypothetical protein  35.62 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1584  transcriptional regulator YdeO  35.62 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.249999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2158  transcriptional regulator YdeO  35.62 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2147  transcriptional regulator, AraC family  35.62 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.536456  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03363  DNA-binding transcriptional activator  36.02 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0198  transcriptional regulator, AraC family  36.02 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4875  transcriptional regulator GadW  36.02 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3717  transcriptional regulator GadW  36.02 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.347301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0202  AraC family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.503691 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4001  transcriptional regulator GadW  35.59 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3913  transcriptional regulator GadW  35.59 
 
 		 242 aa  132  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0304  putative transcription regulator  33.62 
 
 		 247 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.569536 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3818  transcriptional regulator GadW  35.59 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0200734 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1647  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 237 aa  121  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073277  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3065  transcriptional regulator, AraC family  38.36 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0508802  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4661  AraC family regulatory protein  44.44 
 
 		 291 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4661  AraC family regulatory protein  44.44 
 
 		 291 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4570  AraC family regulatory protein  44.44 
 
 		 291 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.132116  normal  0.374836 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3064  transcriptional regulator HilD  43.93 
 
 		 309 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0281413  normal  0.145015 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3080  transcriptional regulator HilD  43.93 
 
 		 309 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  hitchhiker  0.000243626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2194  putative transcriptional regulator  31.69 
 
 		 195 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000326413  hitchhiker  0.0000000776188 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3028  transcriptional regulator HilD  43.93 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000980796  normal  0.0102842 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2997  transcriptional regulator HilD  43.93 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124423  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4576  AraC family regulatory protein  43.43 
 
 		 291 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4710  AraC family regulatory protein  43.43 
 
 		 291 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3185  transcriptional regulator HilD  42.99 
 
 		 309 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.66129 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1164  putative envelope protein encoded within prophage CP-933N  32.79 
 
 		 195 aa  92  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.378647 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2989  transcriptional regulator, AraC family  30.97 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.326814  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3056  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.106838 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3020  transcriptional regulator, AraC family  30.97 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0395557 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3072  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.879002  hitchhiker  0.00256157 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3177  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.246411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4690  porin thermoregulatory protein EnvY  29.74 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4641  porin thermoregulatory protein EnvY  30.96 
 
 		 253 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.841286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4550  porin thermoregulatory protein EnvY  30.96 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.578175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4641  porin thermoregulatory protein EnvY  30.96 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3819  DNA-binding transcriptional regulator GadX  38.89 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660589 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0066  AraC family transcription regulator  35.37 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0603708  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03364  DNA-binding transcriptional dual regulator  38.89 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0197  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4003  DNA-binding transcriptional regulator GadX  38.89 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3719  DNA-binding transcriptional regulator GadX  38.89 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.842811  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03317  hypothetical protein  38.89 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3914  DNA-binding transcriptional regulator GadX  38.89 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0201  DNA-binding transcriptional regulator GadX  38.89 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4877  DNA-binding transcriptional regulator GadX  38.89 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3929  putative fimbrial operon positive regulatory protein FanR  41.84 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.9126 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4884  hypothetical protein  40 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200087 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0092  transcriptional activator of virulence loci  38.76 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3911  AraC family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.508858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4670  transcriptional regulator AdiY  39.23 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4581  transcriptional regulator AdiY  39.23 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5629  transcriptional regulator AdiY  39.23 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4356  transcriptional regulator AdiY  39.23 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.823091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4613  transcriptional regulator AdiY  39.23 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03948  hypothetical protein  37.8 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03987  DNA-binding transcriptional activator  37.8 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3876  transcriptional regulator, AraC family  37.8 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0031  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3063  transcriptional regulator, AraC family  40.15 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00454347  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0639  transcriptional regulator, AraC family  40.15 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.994132  normal  0.332523 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0583  AraC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3086  AraC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.790206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0579  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1953  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0209316  normal  0.951803 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1505  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000918966  hitchhiker  0.0000679283 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2944  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0636812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1123  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.14002e-21 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1157  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.220941  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1191  regulatory protein  31.96 
 
 		 262 aa  65.1  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1145  regulatory protein  31.96 
 
 		 262 aa  65.1  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103899  normal  0.251225 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1040  regulatory protein  31.96 
 
 		 262 aa  65.1  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.907674  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4301  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 284 aa  65.1  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2286  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4081  helix-turn-helix domain-containing protein  34.52 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2385  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4168  AraC family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2142  transcriptional regulator, AraC family  29.59 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3973  transcriptional regulator, AraC family  34.52 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2019  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4050  helix-turn-helix domain-containing protein  34.57 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4563  transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1854  transcriptional regulator, AraC family  26.92 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.191577  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0595  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3868  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0359571 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0317  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0281  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3849  helix-turn-helix, Fis-type  32.32 
 
 		 352 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4573  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 342 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0363  TCP pilus virulence regulatory protein  25.82 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.93807  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1698  AraC family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.757591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3400  transcriptional regulator, AraC family  23.96 
 
 		 274 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.558312  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2412  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 386 aa  52.8  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.462091  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>