292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1164 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1164  putative envelope protein encoded within prophage CP-933N  100 
 
 		 195 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.378647 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2194  putative transcriptional regulator  89.74 
 
 		 195 aa  363  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000326413  hitchhiker  0.0000000776188 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0304  putative transcription regulator  39.15 
 
 		 247 aa  132  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.569536 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1647  AraC family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073277  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03363  DNA-binding transcriptional activator  37.1 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0198  transcriptional regulator, AraC family  37.1 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4875  transcriptional regulator GadW  37.1 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0202  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.503691 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3717  transcriptional regulator GadW  37.1 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.347301  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4001  transcriptional regulator GadW  37.3 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3913  transcriptional regulator GadW  37.3 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3818  transcriptional regulator GadW  36.22 
 
 		 242 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0200734 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1674  transcriptional regulator YdeO  34.78 
 
 		 253 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1689  transcriptional regulator YdeO  34.39 
 
 		 253 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2112  transcriptional regulator YdeO  34.39 
 
 		 253 aa  95.1  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.817957  normal  0.345974 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01457  predicted DNA-binding transcriptional acfivator  40.48 
 
 		 253 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2158  transcriptional regulator YdeO  40.48 
 
 		 253 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1762  transcriptional regulator YdeO  40.48 
 
 		 253 aa  93.6  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1584  transcriptional regulator YdeO  40.48 
 
 		 253 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.249999  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01470  hypothetical protein  40.48 
 
 		 253 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2147  transcriptional regulator, AraC family  40.48 
 
 		 253 aa  92  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.536456  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0052  HTH-type transcriptional regulator YdeO  32.79 
 
 		 240 aa  92  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3065  transcriptional regulator, AraC family  29.69 
 
 		 249 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0508802  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4550  porin thermoregulatory protein EnvY  44.44 
 
 		 243 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.578175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4690  porin thermoregulatory protein EnvY  44.44 
 
 		 243 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4641  porin thermoregulatory protein EnvY  44.44 
 
 		 243 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4641  porin thermoregulatory protein EnvY  44.44 
 
 		 253 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.841286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3914  DNA-binding transcriptional regulator GadX  40.13 
 
 		 274 aa  87.8  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4003  DNA-binding transcriptional regulator GadX  40.13 
 
 		 274 aa  87.8  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4877  DNA-binding transcriptional regulator GadX  40.13 
 
 		 274 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03364  DNA-binding transcriptional dual regulator  38.31 
 
 		 274 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0197  transcriptional regulator, AraC family  38.31 
 
 		 274 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3719  DNA-binding transcriptional regulator GadX  38.31 
 
 		 274 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.842811  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0201  DNA-binding transcriptional regulator GadX  38.31 
 
 		 274 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03317  hypothetical protein  38.31 
 
 		 274 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03987  DNA-binding transcriptional activator  33.16 
 
 		 253 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3876  transcriptional regulator, AraC family  33.16 
 
 		 253 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3911  AraC family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 253 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.508858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4356  transcriptional regulator AdiY  33.16 
 
 		 253 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.823091  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3819  DNA-binding transcriptional regulator GadX  41.41 
 
 		 274 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660589 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4581  transcriptional regulator AdiY  33.16 
 
 		 253 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5629  transcriptional regulator AdiY  33.16 
 
 		 253 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4613  transcriptional regulator AdiY  33.16 
 
 		 253 aa  85.9  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03948  hypothetical protein  33.16 
 
 		 253 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4670  transcriptional regulator AdiY  33.16 
 
 		 253 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0579  AraC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 253 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0583  AraC family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 253 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3063  transcriptional regulator, AraC family  44.88 
 
 		 253 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00454347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3086  AraC family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 253 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.790206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0639  transcriptional regulator, AraC family  44.88 
 
 		 253 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.994132  normal  0.332523 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4884  hypothetical protein  32.35 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3929  putative fimbrial operon positive regulatory protein FanR  35.71 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.9126 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0066  AraC family transcription regulator  33.06 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0603708  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0092  transcriptional activator of virulence loci  34.43 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4661  AraC family regulatory protein  32.35 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3028  transcriptional regulator HilD  37.38 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000980796  normal  0.0102842 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2997  transcriptional regulator HilD  37.38 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124423  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4661  AraC family regulatory protein  32.35 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4570  AraC family regulatory protein  32.35 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.132116  normal  0.374836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3080  transcriptional regulator HilD  37.38 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  hitchhiker  0.000243626 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3064  transcriptional regulator HilD  37.38 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0281413  normal  0.145015 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4710  AraC family regulatory protein  32.35 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4576  AraC family regulatory protein  32.35 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3185  transcriptional regulator HilD  36.45 
 
 		 309 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.66129 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3072  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 295 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.879002  hitchhiker  0.00256157 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0031  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2989  transcriptional regulator, AraC family  39.56 
 
 		 295 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.326814  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3020  transcriptional regulator, AraC family  39.56 
 
 		 295 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0395557 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3177  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 295 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.246411 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3056  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 295 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.106838 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1505  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000918966  hitchhiker  0.0000679283 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1854  transcriptional regulator, AraC family  29.08 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.191577  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1884  AraC family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0204154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1953  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0209316  normal  0.951803 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2944  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 288 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0636812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2142  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05569  transcription regulator protein  30.69 
 
 		 387 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4147  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 331 aa  55.5  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.903101 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 347 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 352 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 373 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1040  regulatory protein  31.96 
 
 		 262 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.907674  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4563  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 284 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1145  regulatory protein  31.96 
 
 		 262 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103899  normal  0.251225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5769  putative transcriptional regulator  33.64 
 
 		 341 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1191  regulatory protein  31.96 
 
 		 262 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1123  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 262 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.14002e-21 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1157  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 262 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.220941  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  35.92 
 
 		 344 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 360 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1584  two component AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 259 aa  53.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0872  helix-turn-helix domain-containing protein  29.36 
 
 		 257 aa  52.8  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.321914 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0317  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 252 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 343 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66530  putative transcriptional regulator  33.64 
 
 		 357 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4168  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3973  transcriptional regulator, AraC family  33.06 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 343 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 364 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4081  helix-turn-helix domain-containing protein  33.06 
 
 		 252 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>