More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2194 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2194  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  402  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000326413  hitchhiker  0.0000000776188 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1164  putative envelope protein encoded within prophage CP-933N  89.74 
 
 		 195 aa  363  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.378647 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0304  putative transcription regulator  38.62 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.569536 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1647  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073277  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03363  DNA-binding transcriptional activator  36.07 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0198  transcriptional regulator, AraC family  36.07 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3913  transcriptional regulator GadW  36.07 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0202  AraC family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.503691 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4875  transcriptional regulator GadW  36.07 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3717  transcriptional regulator GadW  36.07 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.347301  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4001  transcriptional regulator GadW  35.52 
 
 		 242 aa  108  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3818  transcriptional regulator GadW  34.97 
 
 		 242 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0200734 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2112  transcriptional regulator YdeO  33.68 
 
 		 253 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.817957  normal  0.345974 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01457  predicted DNA-binding transcriptional acfivator  33.16 
 
 		 253 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1762  transcriptional regulator YdeO  33.16 
 
 		 253 aa  96.7  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1674  transcriptional regulator YdeO  33.16 
 
 		 253 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01470  hypothetical protein  33.16 
 
 		 253 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1689  transcriptional regulator YdeO  33.16 
 
 		 253 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1584  transcriptional regulator YdeO  33.16 
 
 		 253 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.249999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2158  transcriptional regulator YdeO  33.16 
 
 		 253 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2147  transcriptional regulator, AraC family  33.16 
 
 		 253 aa  95.1  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.536456  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4550  porin thermoregulatory protein EnvY  34.48 
 
 		 243 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.578175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4641  porin thermoregulatory protein EnvY  34.48 
 
 		 243 aa  94.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4690  porin thermoregulatory protein EnvY  34.48 
 
 		 243 aa  94.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4641  porin thermoregulatory protein EnvY  34.48 
 
 		 253 aa  94.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.841286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0052  HTH-type transcriptional regulator YdeO  31.69 
 
 		 240 aa  94  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3065  transcriptional regulator, AraC family  30.26 
 
 		 249 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0508802  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3914  DNA-binding transcriptional regulator GadX  42.42 
 
 		 274 aa  87  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4877  DNA-binding transcriptional regulator GadX  41.98 
 
 		 274 aa  87  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3819  DNA-binding transcriptional regulator GadX  42.52 
 
 		 274 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660589 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4003  DNA-binding transcriptional regulator GadX  42.42 
 
 		 274 aa  87  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0579  AraC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 253 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3063  transcriptional regulator, AraC family  40.58 
 
 		 253 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00454347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3086  AraC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 253 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.790206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0583  AraC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 253 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0639  transcriptional regulator, AraC family  40.58 
 
 		 253 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.994132  normal  0.332523 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03364  DNA-binding transcriptional dual regulator  41.09 
 
 		 274 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03987  DNA-binding transcriptional activator  33.16 
 
 		 253 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0197  transcriptional regulator, AraC family  41.09 
 
 		 274 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3876  transcriptional regulator, AraC family  33.16 
 
 		 253 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03948  hypothetical protein  33.16 
 
 		 253 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3911  AraC family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 253 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.508858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4581  transcriptional regulator AdiY  33.16 
 
 		 253 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4670  transcriptional regulator AdiY  33.16 
 
 		 253 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03317  hypothetical protein  41.09 
 
 		 274 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4613  transcriptional regulator AdiY  33.16 
 
 		 253 aa  86.3  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5629  transcriptional regulator AdiY  33.16 
 
 		 253 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4356  transcriptional regulator AdiY  33.16 
 
 		 253 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.823091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3719  DNA-binding transcriptional regulator GadX  41.09 
 
 		 274 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.842811  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0201  DNA-binding transcriptional regulator GadX  41.09 
 
 		 274 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4884  hypothetical protein  35.77 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3929  putative fimbrial operon positive regulatory protein FanR  35.71 
 
 		 276 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.9126 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0066  AraC family transcription regulator  34.43 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0603708  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3028  transcriptional regulator HilD  36.94 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000980796  normal  0.0102842 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3064  transcriptional regulator HilD  36.94 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0281413  normal  0.145015 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0092  transcriptional activator of virulence loci  33.33 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2997  transcriptional regulator HilD  36.94 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124423  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3080  transcriptional regulator HilD  36.94 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  hitchhiker  0.000243626 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3185  transcriptional regulator HilD  36.04 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.66129 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0031  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4661  AraC family regulatory protein  37.17 
 
 		 291 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4661  AraC family regulatory protein  37.17 
 
 		 291 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4570  AraC family regulatory protein  37.17 
 
 		 291 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.132116  normal  0.374836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2989  transcriptional regulator, AraC family  39.56 
 
 		 295 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.326814  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3072  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 295 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.879002  hitchhiker  0.00256157 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3177  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 295 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.246411 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4576  AraC family regulatory protein  37.17 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1505  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000918966  hitchhiker  0.0000679283 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4710  AraC family regulatory protein  37.17 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3056  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 295 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.106838 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3020  transcriptional regulator, AraC family  39.56 
 
 		 295 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0395557 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1884  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0204154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1953  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0209316  normal  0.951803 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2944  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0636812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1854  transcriptional regulator, AraC family  31.45 
 
 		 285 aa  58.2  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.191577  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 347 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2142  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0872  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.321914 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 347 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 336 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 336 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4563  transcriptional regulator, AraC family  30.41 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4147  AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 331 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.903101 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 333 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 344 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 333 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0317  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 252 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  26.72 
 
 		 324 aa  53.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1537  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 339 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000218585  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 344 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2019  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 291 aa  52.4  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4301  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 284 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2385  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 291 aa  52.4  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2286  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 291 aa  52  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3973  transcriptional regulator, AraC family  33.06 
 
 		 252 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4168  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 252 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 352 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 373 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 345 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4081  helix-turn-helix domain-containing protein  33.06 
 
 		 252 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>