More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06341 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06341  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  540  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001408  transcriptional regulator AraC/XylS family  75.97 
 
 		 259 aa  417  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0872  helix-turn-helix domain-containing protein  42.8 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.321914 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0595  AraC/XylS family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1247  AraC family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1918  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0612288 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1460  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  31.15 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.133338  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0317  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0281  AraC family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3868  AraC family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0359571 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3973  transcriptional regulator, AraC family  32.13 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4168  AraC family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4050  helix-turn-helix domain-containing protein  32.13 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4081  helix-turn-helix domain-containing protein  32.13 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1123  AraC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 262 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.14002e-21 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1040  regulatory protein  27.94 
 
 		 262 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.907674  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1191  regulatory protein  27.94 
 
 		 262 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1145  regulatory protein  27.94 
 
 		 262 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103899  normal  0.251225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1157  AraC family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.220941  normal  0.673316 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00496  predicted DNA-binding transcriptional regulator  24.51 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00501  hypothetical protein  24.51 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3225  transcriptional regulator, AraC family  24.51 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.778963  hitchhiker  0.00123276 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1854  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.191577  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2142  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2034  AraC family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2169  AraC family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.841955  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1953  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0209316  normal  0.951803 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3080  transcriptional regulator HilD  36.45 
 
 		 309 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  hitchhiker  0.000243626 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3064  transcriptional regulator HilD  36.45 
 
 		 309 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0281413  normal  0.145015 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3185  transcriptional regulator HilD  36.45 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.66129 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2997  transcriptional regulator HilD  36.45 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124423  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3028  transcriptional regulator HilD  36.45 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000980796  normal  0.0102842 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3065  transcriptional regulator, AraC family  26.28 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0508802  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2019  AraC family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2385  AraC family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2286  AraC family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2944  AraC family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 288 aa  72  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0636812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4570  AraC family regulatory protein  39.51 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.132116  normal  0.374836 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4661  AraC family regulatory protein  39.51 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4661  AraC family regulatory protein  39.51 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4301  transcriptional regulator, AraC family  27.66 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4710  AraC family regulatory protein  39.51 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4576  AraC family regulatory protein  39.51 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4563  transcriptional regulator, AraC family  28.09 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1698  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.757591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1505  AraC family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000918966  hitchhiker  0.0000679283 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3400  transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.558312  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3135  transcriptional regulator, AraC family  22.8 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0304  putative transcription regulator  32.91 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.569536 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0986  transcriptional regulator, AraC family  25.61 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.949887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3063  transcriptional regulator, AraC family  39.06 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00454347  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0639  transcriptional regulator, AraC family  39.06 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.994132  normal  0.332523 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0579  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0583  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3086  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.790206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  32.58 
 
 		 1355 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3929  putative fimbrial operon positive regulatory protein FanR  23.88 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.9126 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1103  transcriptional regulator, AraC family  39.02 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  32.65 
 
 		 1340 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  37.8 
 
 		 1316 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 322 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3849  helix-turn-helix, Fis-type  31.19 
 
 		 352 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 343 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3020  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0395557 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2989  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.326814  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4641  porin thermoregulatory protein EnvY  31.76 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.841286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4641  porin thermoregulatory protein EnvY  31.76 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4550  porin thermoregulatory protein EnvY  31.76 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.578175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3056  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.106838 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0306  AraC family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3072  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.879002  hitchhiker  0.00256157 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4690  porin thermoregulatory protein EnvY  31.76 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3177  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.246411 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0789  AraC family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 364 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3819  DNA-binding transcriptional regulator GadX  33.33 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660589 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2593  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 335 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03987  DNA-binding transcriptional activator  31.76 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  38.27 
 
 		 1342 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3911  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.508858  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3876  transcriptional regulator, AraC family  31.76 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3913  transcriptional regulator GadW  29.52 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4581  transcriptional regulator AdiY  31.76 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2601  putative transcriptional regulator  30.09 
 
 		 342 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0251856 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03948  hypothetical protein  31.76 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4670  transcriptional regulator AdiY  31.76 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5629  transcriptional regulator AdiY  31.76 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1732  AraC family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 340 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4594  helix-turn-helix domain-containing protein  30.48 
 
 		 346 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.359709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4356  transcriptional regulator AdiY  31.76 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.823091  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5355  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 340 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.924239 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4001  transcriptional regulator GadW  29.52 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4613  transcriptional regulator AdiY  31.76 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3818  transcriptional regulator GadW  30.39 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0200734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>