More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3135 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3135  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 282 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0986  transcriptional regulator, AraC family  67.4 
 
 		 279 aa  332  5e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.949887  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2944  AraC family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 288 aa  122  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0636812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2385  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2019  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2286  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1191  regulatory protein  30.68 
 
 		 262 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1040  regulatory protein  30.68 
 
 		 262 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.907674  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1145  regulatory protein  30.68 
 
 		 262 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103899  normal  0.251225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1123  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.14002e-21 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1157  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.220941  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2034  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2169  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.841955  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1953  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 268 aa  87  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0209316  normal  0.951803 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00496  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.73 
 
 		 265 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3225  transcriptional regulator, AraC family  27.73 
 
 		 265 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.778963  hitchhiker  0.00123276 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00501  hypothetical protein  27.73 
 
 		 265 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4563  transcriptional regulator, AraC family  27.39 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4301  transcriptional regulator, AraC family  26.96 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3868  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0359571 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3400  transcriptional regulator, AraC family  25.2 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.558312  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2142  transcriptional regulator, AraC family  24.78 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0317  AraC/XylS family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1698  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.757591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0281  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1460  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  26.02 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.133338  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2600  AraC family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1854  transcriptional regulator, AraC family  30.33 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.191577  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3973  transcriptional regulator, AraC family  24.7 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4168  AraC family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4081  helix-turn-helix domain-containing protein  24.3 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4050  helix-turn-helix domain-containing protein  25.1 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4594  helix-turn-helix domain-containing protein  40.2 
 
 		 346 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.359709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 345 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 345 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0595  AraC/XylS family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2100  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3080  transcriptional regulator HilD  30.19 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  hitchhiker  0.000243626 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3028  transcriptional regulator HilD  30.19 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000980796  normal  0.0102842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2997  transcriptional regulator HilD  30.19 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124423  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1505  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000918966  hitchhiker  0.0000679283 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3064  transcriptional regulator HilD  30.19 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0281413  normal  0.145015 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001408  transcriptional regulator AraC/XylS family  23.11 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3185  transcriptional regulator HilD  29.25 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.66129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0872  helix-turn-helix domain-containing protein  23.89 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.321914 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3849  helix-turn-helix, Fis-type  35.51 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06341  hypothetical protein  22.89 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5651  transcriptional regulator, AraC family  36.54 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4661  AraC family regulatory protein  26.92 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4570  AraC family regulatory protein  26.92 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.132116  normal  0.374836 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01697  hypothetical protein  24.9 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4661  AraC family regulatory protein  26.92 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4576  AraC family regulatory protein  26.92 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4710  AraC family regulatory protein  26.92 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4356  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 366 aa  62.4  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2147  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.536456  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3065  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0508802  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3152  transcriptional regulator, AraC family  34.91 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0294751  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003334  type III secretion thermoregulatory protein (LcrF,VirF,transcription regulation of virulence plasmid)  24.41 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1083  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0148989 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2141  AraC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.755831  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3774  transcriptional regulator, AraC family  32.39 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  36.46 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2112  transcriptional regulator YdeO  25.12 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.817957  normal  0.345974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3929  putative fimbrial operon positive regulatory protein FanR  24.27 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.9126 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5980  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 357 aa  58.9  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0304  putative transcription regulator  36.71 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.569536 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01457  predicted DNA-binding transcriptional acfivator  31.45 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1584  transcriptional regulator YdeO  31.45 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.249999  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1689  transcriptional regulator YdeO  25.12 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1762  transcriptional regulator YdeO  31.45 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01470  hypothetical protein  31.45 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2158  transcriptional regulator YdeO  31.45 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1674  transcriptional regulator YdeO  25.12 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1918  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0612288 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3046  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5125  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.506358  normal  0.385561 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  37.66 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1192  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933136  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1094  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0246  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 336 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3744  transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 377 aa  57  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  41.77 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16600  transcriptional regulator, AraC family  25.51 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0747  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40849  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3056  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.106838 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2989  transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.326814  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3914  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3020  transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0395557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3940  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.423213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3177  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.246411 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3072  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.879002  hitchhiker  0.00256157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>