More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1016 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1016  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 205 aa  428  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0662506  normal  0.784633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3514  30S ribosomal protein S4  80.98 
 
 		 205 aa  354  5e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.512589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1927  30S ribosomal protein S4  76.47 
 
 		 205 aa  334  7e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0826  30S ribosomal protein S4  75.49 
 
 		 205 aa  333  1e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0783117  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1270  30S ribosomal protein S4  75 
 
 		 205 aa  330  7.000000000000001e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450634  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2948  30S ribosomal protein S4  75.61 
 
 		 206 aa  328  4e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0134327 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0823  30S ribosomal protein S4  73.53 
 
 		 205 aa  328  5.0000000000000004e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0830  30S ribosomal protein S4  73.04 
 
 		 205 aa  325  3e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1514  30S ribosomal protein S4  74.51 
 
 		 205 aa  325  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2283  30S ribosomal protein S4  73.04 
 
 		 206 aa  323  9e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0958  30S ribosomal protein S4  73.04 
 
 		 206 aa  323  9e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0208239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2214  30S ribosomal protein S4  73.53 
 
 		 206 aa  323  9e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2396  30S ribosomal protein S4  71.08 
 
 		 205 aa  323  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0954  30S ribosomal protein S4  73.53 
 
 		 206 aa  322  2e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2156  30S ribosomal protein S4  73.04 
 
 		 205 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1947  30S ribosomal protein S4  73.04 
 
 		 205 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.515321  normal  0.962011 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4303  30S ribosomal protein S4  70.1 
 
 		 206 aa  316  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2107  30S ribosomal protein S4  72.55 
 
 		 206 aa  315  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2583  30S ribosomal protein S4  70.59 
 
 		 206 aa  311  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal  0.610834 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4095  30S ribosomal protein S4  72.06 
 
 		 205 aa  310  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1740  30S ribosomal protein S4  70.1 
 
 		 205 aa  304  7e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1316  30S ribosomal protein S4  66.67 
 
 		 205 aa  303  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5388  30S ribosomal protein S4  67.16 
 
 		 205 aa  302  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5277  30S ribosomal protein S4  70.59 
 
 		 205 aa  301  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.9692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1777  30S ribosomal protein S4  67.16 
 
 		 205 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1140  30S ribosomal protein S4  69.12 
 
 		 204 aa  301  5.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.768431  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4737  30S ribosomal protein S4  70.1 
 
 		 205 aa  300  9e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5204  30S ribosomal protein S4  70.1 
 
 		 205 aa  300  9e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.228879 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1644  30S ribosomal protein S4  67.16 
 
 		 205 aa  300  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  70.1 
 
 		 205 aa  299  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1765  30S ribosomal protein S4  66.67 
 
 		 205 aa  298  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0786  30S ribosomal protein S4  69.12 
 
 		 203 aa  298  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171275  normal  0.376942 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1256  30S ribosomal protein S4  70.1 
 
 		 205 aa  298  4e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  0.108405 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0701  30S ribosomal protein S4  67.16 
 
 		 204 aa  296  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0664  30S ribosomal protein S4  67.65 
 
 		 204 aa  296  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359087  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1603  30S ribosomal protein S4  65.2 
 
 		 205 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.176255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0359  30S ribosomal protein S4  68.14 
 
 		 205 aa  295  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3699  30S ribosomal protein S4  65.2 
 
 		 205 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.658744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0105  30S ribosomal protein S4  68.63 
 
 		 205 aa  294  5e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2249  30S ribosomal protein S4  67.65 
 
 		 205 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0123403  normal  0.0465366 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2245  30S ribosomal protein S4  64.71 
 
 		 203 aa  291  5e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.892305  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0388  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 204 aa  216  1e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0194  30S ribosomal protein S4  45.96 
 
 		 202 aa  197  6e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0912  30S ribosomal protein S4  45.96 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5891  RNA-binding S4 domain protein  62.68 
 
 		 146 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0583  ribosomal protein S4  43.41 
 
 		 205 aa  182  4.0000000000000006e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  45.59 
 
 		 200 aa  177  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  45.1 
 
 		 200 aa  177  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  45.1 
 
 		 200 aa  174  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  44.12 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  44.12 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  44.12 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  44.12 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  44.12 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  44.12 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  44.12 
 
 		 200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  43.63 
 
 		 200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  44.61 
 
 		 200 aa  171  5e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  44.61 
 
 		 200 aa  171  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  44.12 
 
 		 200 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0344  30S ribosomal protein S4  44.08 
 
 		 209 aa  168  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.423009  unclonable  0.0000000464518 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  43.14 
 
 		 200 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  43.14 
 
 		 200 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  45.45 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  45.54 
 
 		 208 aa  168  6e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3313  30S ribosomal protein S4  44.55 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 208 aa  165  4e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  44.95 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0915  30S ribosomal protein S4  42.51 
 
 		 209 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  44.39 
 
 		 203 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.39 
 
 		 211 aa  164  8e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  46.96 
 
 		 206 aa  164  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  44.06 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0429  30S ribosomal protein S4  42.18 
 
 		 209 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.857828  normal  0.0845292 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  44.55 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  43.94 
 
 		 203 aa  162  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2814  30S ribosomal protein S4  44.39 
 
 		 207 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0136866  normal  0.264944 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 203 aa  161  7e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  41.67 
 
 		 201 aa  160  9e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  44.55 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  46.7 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  42.93 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3472  30S ribosomal protein S4  42.44 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0791  30S ribosomal protein S4  42.18 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.068053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0352  30S ribosomal protein S4  42.44 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2734  30S ribosomal protein S4  42.44 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  40.69 
 
 		 200 aa  159  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0373  30S ribosomal protein S4  42.44 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.762852  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0500  30S ribosomal protein S4  42.92 
 
 		 207 aa  158  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0301  30S ribosomal protein S4  41.95 
 
 		 207 aa  158  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152221  normal  0.0772792 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  41.92 
 
 		 203 aa  158  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  42.93 
 
 		 201 aa  158  7e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3043  30S ribosomal protein S4  42.93 
 
 		 207 aa  158  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0344  30S ribosomal protein S4  41.98 
 
 		 207 aa  158  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311272  decreased coverage  0.0000419462 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3779  30S ribosomal protein S4  42.93 
 
 		 207 aa  157  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2607  30S ribosomal protein S4  42.44 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3751  30S ribosomal protein S4  42.44 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379241  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0625  30S ribosomal protein S4  41.51 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0292  30S ribosomal protein S4  41.46 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1949  30S ribosomal protein S4  42.44 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>