96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0176 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0176  outer membrane protein  100 
 
 
414 aa  814    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00318  putative cation efflux protein  31.18 
 
 
454 aa  182  9.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4856  putative cation efflux protein  30.19 
 
 
496 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1929  outer membrane efflux protein  32.49 
 
 
447 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.845235  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0134  outer membrane efflux protein  31.59 
 
 
439 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1388  outer membrane efflux protein  35.59 
 
 
417 aa  152  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.615787 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1368  copper/silver resistance outer membrane protein  26.25 
 
 
437 aa  143  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2394  outer membrane efflux protein  29.29 
 
 
487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0716  hypothetical protein  28.01 
 
 
444 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06364  hypothetical protein  27.82 
 
 
463 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001397  heavy metal RND efflux CzcC family  25.76 
 
 
473 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  26.85 
 
 
501 aa  119  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  26.55 
 
 
426 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1619  outer membrane efflux protein  28.36 
 
 
427 aa  106  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.891221  hitchhiker  0.0000204841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1949  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  28.36 
 
 
427 aa  106  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  26.03 
 
 
449 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2210  outer membrane efflux protein  27.46 
 
 
420 aa  103  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0896895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3493  outer membrane efflux protein  27.88 
 
 
428 aa  103  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2062  outer membrane efflux protein  28.21 
 
 
436 aa  102  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2434  outer membrane efflux protein  28.21 
 
 
433 aa  102  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.990538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0170  outer membrane efflux protein  27.76 
 
 
436 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2548  outer membrane efflux protein  29.11 
 
 
408 aa  99.4  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2892  outer membrane efflux protein  29.32 
 
 
419 aa  97.8  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4511  outer membrane efflux protein  27.48 
 
 
428 aa  95.9  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336672  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2394  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  27.46 
 
 
418 aa  94  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.794005  hitchhiker  0.00223071 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1335  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  29.41 
 
 
429 aa  94  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  25.94 
 
 
440 aa  93.2  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05407  putative outer membrane cation efflux protein  31.12 
 
 
434 aa  90.9  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1167  outer membrane efflux protein  27.14 
 
 
419 aa  89.7  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1807  cobalt-zinc-cadmium resistance outer membrane porin  27.55 
 
 
433 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1155  hypothetical protein  27.13 
 
 
418 aa  88.6  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1261  outer membrane efflux protein  28.29 
 
 
419 aa  87  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6134  proton antiporter metal efflux protein SilC  31.09 
 
 
435 aa  87.4  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144513  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3364  outer membrane efflux protein  28.65 
 
 
419 aa  86.7  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0128671  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3073  outer membrane efflux protein  28.4 
 
 
419 aa  86.7  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0020  outer membrane efflux protein  26.81 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257437  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0022  outer membrane efflux protein  26.81 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2439  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  27.57 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0020  outer membrane efflux protein  26.81 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0171536 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0475  putative outer membrane cation efflux protein  27 
 
 
437 aa  84.7  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.668446  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  24.28 
 
 
466 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5357  outer membrane efflux protein  28.42 
 
 
433 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5385  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  27.23 
 
 
417 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5031  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin CusC  28.28 
 
 
433 aa  79.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.11545 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2395  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  26.24 
 
 
409 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502937  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  26.9 
 
 
443 aa  77  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 
424 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6301  outer membrane efflux protein  28.22 
 
 
410 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6284  outer membrane efflux protein  24.81 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524439  normal  0.254062 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5180  outer membrane efflux protein  24.37 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1625  putative outer membrane cation efflux protein  26.33 
 
 
438 aa  71.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.164606 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  24.06 
 
 
423 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3343  outer membrane efflux protein  24.37 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2326  outer membrane efflux protein  27 
 
 
407 aa  70.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.347361  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4116  outer membrane efflux protein  25.18 
 
 
430 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3400  outer membrane efflux protein  25.18 
 
 
430 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4767  outer membrane efflux protein  25.18 
 
 
430 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  23.83 
 
 
446 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  23.25 
 
 
423 aa  67  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  23.67 
 
 
426 aa  64.3  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2363  chemiosmotic efflux system B protein C  23.91 
 
 
419 aa  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1648  outer membrane efflux protein  25.51 
 
 
434 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5289  outer membrane efflux protein  25.51 
 
 
434 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  25.37 
 
 
416 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5688  outer membrane efflux protein  23.88 
 
 
430 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0325821  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  22 
 
 
443 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  22.59 
 
 
424 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  23.91 
 
 
424 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2050  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  24.86 
 
 
411 aa  57  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202753 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4013  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  27.54 
 
 
414 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498662  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  22.69 
 
 
445 aa  56.2  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3041  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 
417 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764893  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0512  outer membrane efflux protein  27.05 
 
 
433 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  21.51 
 
 
424 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0330  outer membrane efflux protein  27.05 
 
 
433 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3044  outer membrane efflux protein  26.23 
 
 
433 aa  53.1  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3374  outer membrane efflux protein  26.23 
 
 
433 aa  53.1  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2236  outer membrane efflux protein  26.23 
 
 
433 aa  53.1  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2048  outer membrane efflux protein  26.23 
 
 
433 aa  53.1  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 
426 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  22.63 
 
 
424 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  21.79 
 
 
438 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0317  outer membrane efflux protein  25.82 
 
 
433 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.32 
 
 
493 aa  50.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4257  outer membrane efflux protein  25.66 
 
 
473 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0288  outer membrane efflux protein  34.95 
 
 
464 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.708573  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3978  outer membrane efflux protein  24.19 
 
 
446 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4234  outer membrane efflux protein  25.66 
 
 
473 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702007  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4262  outer membrane efflux protein  24.06 
 
 
477 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.495542 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  22.63 
 
 
437 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1304  outer membrane efflux protein  24.05 
 
 
493 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0613803 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03275  putative cation efflux protein  26.37 
 
 
117 aa  45.8  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  24.89 
 
 
428 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  23.74 
 
 
415 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1302  outer membrane efflux protein  24.68 
 
 
505 aa  43.1  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  24.55 
 
 
473 aa  43.1  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.151183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>