185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_20690 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_06600  site-specific recombinase, integrase family  97.89 
 
 
491 aa  867    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101148  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20690  site-specific recombinase, integrase family  100 
 
 
426 aa  882    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5578  phage integrase  64.85 
 
 
721 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5981  phage integrase family protein  64.85 
 
 
721 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.259227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1705  phage integrase family protein  64.85 
 
 
737 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602648  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2146  phage integrase family protein  50.36 
 
 
663 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  33.8 
 
 
498 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.353708 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1223  Tn554, transposase B  32.87 
 
 
630 aa  229  6e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.559956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1346  Tn554, transposase B  32.87 
 
 
630 aa  229  6e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2507  transposase B  32.87 
 
 
630 aa  229  6e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0042  phage integrase family protein  32.87 
 
 
630 aa  229  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1716  phage integrase family protein  32.87 
 
 
630 aa  229  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0042  phage integrase family protein  32.87 
 
 
630 aa  229  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1750  phage integrase family protein  32.87 
 
 
630 aa  229  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00214495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  33.49 
 
 
637 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5435  hypothetical protein  57.45 
 
 
352 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4644  phage integrase family protein  28.33 
 
 
637 aa  119  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1114  phage integrase family protein  29.72 
 
 
637 aa  110  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0068  integrase family protein  28 
 
 
461 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0987  Tn554-related, transposase B  23.14 
 
 
708 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.376449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3148  Tn554-related, transposase B  23.19 
 
 
701 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0001  Tn554-related, transposase B  23.19 
 
 
684 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.289716  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1216  integrase family protein  31.11 
 
 
719 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.324318  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3586  integrase family protein  31.11 
 
 
719 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.186678  hitchhiker  0.00677249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3468  integrase family protein  31.11 
 
 
719 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00341973  normal  0.0358232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3699  integrase family protein  31.11 
 
 
719 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0398005  normal  0.195076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3741  integrase family protein  31.11 
 
 
719 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  0.164108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3604  integrase family protein  31.11 
 
 
719 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0140825  normal  0.0766423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3043  integrase family protein  31.11 
 
 
719 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00307933  hitchhiker  0.00706888 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1465  Tn554-related, transposase B  22.66 
 
 
675 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000329851  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0456  phage integrase family protein  26.37 
 
 
647 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3588  phage integrase family protein  26.37 
 
 
647 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00892563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5498  phage integrase family protein  26.37 
 
 
647 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0714023 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4727  integrase family protein  26.25 
 
 
608 aa  87.8  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2671  integrase family protein  26.65 
 
 
608 aa  86.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2584  integrase family protein  26.65 
 
 
608 aa  86.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0479  phage integrase family protein  31.1 
 
 
724 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3897  phage integrase family protein  31.1 
 
 
724 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3903  phage integrase family protein  31.1 
 
 
724 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5934  phage integrase family protein  31.1 
 
 
724 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3615  integrase family protein  28.77 
 
 
638 aa  83.2  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00140934  normal  0.0339314 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2521  integrase family protein  27.87 
 
 
617 aa  82  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000524212  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1238  integrase family protein  27.87 
 
 
617 aa  82  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.375916 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1427  phage integrase family protein  29.92 
 
 
739 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0069  integrase family protein  22.07 
 
 
517 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0513  phage integrase family protein  29.17 
 
 
741 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5419  phage integrase family protein  29.17 
 
 
741 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.244002 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5399  phage integrase family protein  29.17 
 
 
741 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.558609 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4793  phage integrase family protein  25.64 
 
 
797 aa  64.3  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2264  phage integrase family protein  25.64 
 
 
797 aa  64.3  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2973  phage integrase family protein  25.64 
 
 
797 aa  64.3  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.53 
 
 
308 aa  61.6  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  25.64 
 
 
305 aa  61.2  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.94 
 
 
324 aa  60.1  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  25.64 
 
 
297 aa  59.3  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0319  tyrosine recombinase XerD  25.9 
 
 
307 aa  57.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.944891  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.89 
 
 
313 aa  57.4  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  24.92 
 
 
294 aa  54.7  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  25.1 
 
 
310 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  25.43 
 
 
299 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  22.15 
 
 
296 aa  54.3  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1935  phage integrase  23.95 
 
 
710 aa  53.9  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3969  phage integrase family protein  23.95 
 
 
710 aa  53.9  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3804  phage integrase family protein  23.95 
 
 
710 aa  53.9  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  21.53 
 
 
305 aa  53.5  0.000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3610  integrase family protein  23.26 
 
 
827 aa  53.1  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00523009  normal  0.0387105 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 
308 aa  53.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  20.69 
 
 
295 aa  53.1  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  24.65 
 
 
290 aa  52.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  25.32 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1313  tyrosine recombinase XerD  27.85 
 
 
309 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  26.63 
 
 
322 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1579  integrase family protein  22.45 
 
 
744 aa  51.6  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.415833  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  24.66 
 
 
296 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2821  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.1 
 
 
314 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.626713 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  25.44 
 
 
304 aa  50.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  23.45 
 
 
290 aa  50.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  25.37 
 
 
316 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  25.96 
 
 
301 aa  50.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  24.83 
 
 
311 aa  50.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  20.77 
 
 
303 aa  50.1  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  25.77 
 
 
304 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  19.93 
 
 
295 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3749  phage integrase family protein  25.44 
 
 
318 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00852374  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  28.71 
 
 
309 aa  49.3  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  22.26 
 
 
296 aa  49.3  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.7 
 
 
298 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  26.28 
 
 
300 aa  48.9  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  22.77 
 
 
300 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2241  integrase family protein  24.32 
 
 
296 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000667129 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 
322 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  26.97 
 
 
292 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2933  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.36 
 
 
313 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  27.23 
 
 
298 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  24.03 
 
 
299 aa  47.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1113  phage integrase family protein  28.16 
 
 
364 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0671879  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1174  tyrosine recombinase XerD  27.16 
 
 
300 aa  47.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.784052  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1030  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.42 
 
 
307 aa  47.4  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  23.58 
 
 
295 aa  47  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  23.68 
 
 
278 aa  47  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>