More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2728 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  51.9 
 
 		 675 aa  657    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 688 aa  1389    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  46.02 
 
 		 705 aa  529  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  45.41 
 
 		 678 aa  525  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  41.24 
 
 		 691 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  34.61 
 
 		 706 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  34.75 
 
 		 706 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  34.6 
 
 		 706 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  34.61 
 
 		 721 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  34.46 
 
 		 706 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  33.63 
 
 		 728 aa  365  1e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  33.69 
 
 		 705 aa  356  5.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 		 720 aa  353  5.9999999999999994e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 		 700 aa  352  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  33.05 
 
 		 700 aa  352  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 		 700 aa  352  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  34.08 
 
 		 694 aa  352  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  33.05 
 
 		 700 aa  352  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 700 aa  349  8e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  32.77 
 
 		 700 aa  349  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  32.77 
 
 		 700 aa  348  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  32.8 
 
 		 700 aa  346  8.999999999999999e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  32.8 
 
 		 700 aa  346  8.999999999999999e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 		 706 aa  342  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  31.47 
 
 		 726 aa  332  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  32.84 
 
 		 709 aa  330  6e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 715 aa  329  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.12 
 
 		 712 aa  328  3e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 731 aa  324  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  33.08 
 
 		 697 aa  313  5.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 701 aa  311  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  34.64 
 
 		 680 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  30.35 
 
 		 681 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 706 aa  306  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  31.24 
 
 		 742 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  31.3 
 
 		 710 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 		 723 aa  294  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  29.04 
 
 		 743 aa  257  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3353  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 736 aa  232  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130298  normal  0.417052 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 723 aa  231  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 770 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 736 aa  196  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 696 aa  194  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 742 aa  191  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 737 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  24.28 
 
 		 701 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 734 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5774  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 690 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.872771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 692 aa  168  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  26.64 
 
 		 727 aa  160  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 726 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 717 aa  157  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 698 aa  157  7e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 715 aa  157  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 776 aa  155  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  26.01 
 
 		 703 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 688 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 681 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 702 aa  154  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 776 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 713 aa  150  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 706 aa  150  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 780 aa  150  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0733  tonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 680 aa  148  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 774 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  23.98 
 
 		 762 aa  146  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1794  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 664 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 757 aa  144  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5661  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 769 aa  144  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 678 aa  144  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 681 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 791 aa  141  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 682 aa  140  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 716 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  24.96 
 
 		 797 aa  135  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 700 aa  135  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2902  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 791 aa  133  9e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.119413 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 700 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 757 aa  130  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0571  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 778 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 714 aa  122  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 702 aa  121  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 698 aa  120  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  25.17 
 
 		 712 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 733 aa  115  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1728  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 690 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322796  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4137  outer membrane siderophore receptor, putative  25.33 
 
 		 690 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 666 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 711 aa  109  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 704 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1856  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 688 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.0244044 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 730 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  24.37 
 
 		 712 aa  108  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  24.46 
 
 		 646 aa  108  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 688 aa  105  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 779 aa  103  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  24.77 
 
 		 710 aa  103  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 703 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 705 aa  101  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  24.85 
 
 		 711 aa  101  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>