More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0498 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  100 
 
 		 476 aa  978    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  52.22 
 
 		 481 aa  462  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  49.62 
 
 		 454 aa  432  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  45.31 
 
 		 483 aa  430  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  45.62 
 
 		 451 aa  421  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  38.97 
 
 		 497 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  38.21 
 
 		 642 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  39.29 
 
 		 467 aa  310  4e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  37.68 
 
 		 507 aa  295  1e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  39.46 
 
 		 497 aa  291  2e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  38.82 
 
 		 497 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  39.77 
 
 		 514 aa  282  8.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  40.59 
 
 		 500 aa  256  8e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  36.71 
 
 		 437 aa  238  2e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  30.58 
 
 		 474 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  30.54 
 
 		 484 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  35.31 
 
 		 413 aa  211  3e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  34.9 
 
 		 482 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  35.48 
 
 		 492 aa  206  6e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  32.48 
 
 		 484 aa  206  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  30.83 
 
 		 422 aa  180  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  31.95 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  31.39 
 
 		 422 aa  176  6e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  30.32 
 
 		 421 aa  173  5.999999999999999e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  32.08 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  36.2 
 
 		 418 aa  164  3e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  31.11 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  30.55 
 
 		 385 aa  143  5e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  25.53 
 
 		 498 aa  126  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  34.95 
 
 		 325 aa  105  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  30.9 
 
 		 1092 aa  104  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  33.17 
 
 		 348 aa  103  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  27.05 
 
 		 892 aa  102  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  28.33 
 
 		 764 aa  102  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.756935 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  36.45 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  32.37 
 
 		 322 aa  101  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  32.51 
 
 		 326 aa  101  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  32.24 
 
 		 323 aa  100  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  28.01 
 
 		 321 aa  100  7e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  33.01 
 
 		 315 aa  100  8e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  33.66 
 
 		 326 aa  99  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  29.78 
 
 		 289 aa  99  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  33.5 
 
 		 315 aa  98.6  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  29.36 
 
 		 332 aa  98.6  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  33.66 
 
 		 329 aa  99  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  33 
 
 		 318 aa  98.2  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  28.31 
 
 		 1001 aa  97.4  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  29.84 
 
 		 329 aa  97.1  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  29.75 
 
 		 334 aa  96.7  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  28.68 
 
 		 942 aa  96.7  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  31.78 
 
 		 326 aa  96.3  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  32.04 
 
 		 315 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  33 
 
 		 322 aa  95.1  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  31.55 
 
 		 373 aa  94.7  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  32.04 
 
 		 315 aa  95.1  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  31.13 
 
 		 322 aa  94.4  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  32.67 
 
 		 316 aa  94.4  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  32.18 
 
 		 320 aa  94.4  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  30.37 
 
 		 317 aa  93.6  8e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  30.99 
 
 		 347 aa  93.2  9e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  33.99 
 
 		 319 aa  92.8  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  31.86 
 
 		 324 aa  92.8  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  30.29 
 
 		 322 aa  92.4  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  31.71 
 
 		 338 aa  92  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  31.9 
 
 		 322 aa  92.4  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  31.78 
 
 		 326 aa  89  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  31.37 
 
 		 341 aa  88.2  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  31.6 
 
 		 334 aa  87.8  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  31.16 
 
 		 330 aa  87  7e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  30.62 
 
 		 327 aa  86.3  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  30.92 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  30.39 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  27.7 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  26.92 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  29.49 
 
 		 398 aa  79.7  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  29.24 
 
 		 369 aa  79.7  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  27.15 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  31.34 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  28.76 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  34.96 
 
 		 940 aa  70.5  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  27.06 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2909  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.32 
 
 		 687 aa  66.6  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213338 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41967  predicted protein  24.78 
 
 		 235 aa  65.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.296814  normal  0.0690197 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1238  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.14 
 
 		 634 aa  65.9  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48947  predicted protein  22.22 
 
 		 725 aa  63.9  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00599657 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.9 
 
 		 567 aa  63.9  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06694  Chromosome transmission fidelity protein 18 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C1D3]  23.74 
 
 		 993 aa  63.2  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0563098 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.9 
 
 		 520 aa  62.8  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  24.77 
 
 		 548 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11893  DNA polymerase III subunit gamma/tau  25.48 
 
 		 600 aa  62  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.272585  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4530  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.19 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162349  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45690  predicted protein  22.42 
 
 		 1015 aa  60.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136558  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3142  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.44 
 
 		 637 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.27 
 
 		 735 aa  60.8  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2196  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.19 
 
 		 626 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  28.64 
 
 		 575 aa  60.5  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.45 
 
 		 517 aa  60.8  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1861  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.19 
 
 		 628 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.33363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5507  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.32 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.30319 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.85 
 
 		 561 aa  60.1  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>