More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5546 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008703  Mkms_5546  RND superfamily drug efflux protein  100 
 
 		 243 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0356302 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  72.02 
 
 		 1013 aa  288  6e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0456  RND superfamily drug efflux protein  75.69 
 
 		 1110 aa  286  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.850885 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  62.88 
 
 		 944 aa  269  4e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0171  RND superfamily drug efflux protein  75.69 
 
 		 1093 aa  261  8e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188694  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0180  RND superfamily drug efflux protein  75.69 
 
 		 1093 aa  261  8e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0160  RND superfamily drug efflux protein  75.69 
 
 		 1089 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  63.3 
 
 		 1095 aa  245  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  58.14 
 
 		 997 aa  238  6.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  53.29 
 
 		 710 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  45.18 
 
 		 738 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  45.45 
 
 		 718 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  38 
 
 		 1308 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  44.05 
 
 		 733 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  42.77 
 
 		 743 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  41.82 
 
 		 717 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  39.16 
 
 		 757 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  43.71 
 
 		 796 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2658  MMPL domain protein  43.04 
 
 		 841 aa  131  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  41.14 
 
 		 730 aa  131  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  40.51 
 
 		 730 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  41.14 
 
 		 730 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  41.14 
 
 		 730 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  41.14 
 
 		 730 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  41.14 
 
 		 730 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  40.51 
 
 		 730 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  40.51 
 
 		 730 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  40.52 
 
 		 730 aa  129  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  39.33 
 
 		 740 aa  128  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  41.14 
 
 		 730 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  41.67 
 
 		 727 aa  126  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  40.94 
 
 		 723 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.9 
 
 		 740 aa  125  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  38.79 
 
 		 758 aa  125  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  37.77 
 
 		 783 aa  125  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  41.88 
 
 		 735 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.99 
 
 		 1382 aa  124  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  42.41 
 
 		 724 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  37.14 
 
 		 758 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  39.01 
 
 		 738 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  41.57 
 
 		 761 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  39.76 
 
 		 829 aa  123  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  39.76 
 
 		 829 aa  123  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  40.62 
 
 		 735 aa  122  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  40.45 
 
 		 743 aa  122  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  40 
 
 		 766 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  39.39 
 
 		 741 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  39.77 
 
 		 770 aa  118  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  42.53 
 
 		 715 aa  118  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  39.38 
 
 		 779 aa  118  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  35.82 
 
 		 842 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  37.78 
 
 		 761 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  38.65 
 
 		 1002 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  40.62 
 
 		 724 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  38.07 
 
 		 717 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  38.12 
 
 		 726 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  38.07 
 
 		 736 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  40 
 
 		 784 aa  115  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  39.24 
 
 		 729 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  40.7 
 
 		 748 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  39.41 
 
 		 711 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  40.7 
 
 		 754 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  45.18 
 
 		 762 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  38.6 
 
 		 839 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  40.48 
 
 		 738 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  33.51 
 
 		 737 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  38.86 
 
 		 758 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  38.38 
 
 		 778 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  39.62 
 
 		 741 aa  113  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  39.51 
 
 		 772 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  39.51 
 
 		 772 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  39.51 
 
 		 772 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  37.11 
 
 		 779 aa  112  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  37.82 
 
 		 735 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  42.41 
 
 		 796 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  40.85 
 
 		 876 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  37.5 
 
 		 760 aa  111  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  37.63 
 
 		 751 aa  111  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  38.41 
 
 		 743 aa  111  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  35.43 
 
 		 767 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  35.43 
 
 		 767 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  39.04 
 
 		 751 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  35.43 
 
 		 767 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.06 
 
 		 724 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  37.93 
 
 		 740 aa  109  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  36.94 
 
 		 743 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  41.67 
 
 		 731 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.65 
 
 		 740 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  34.22 
 
 		 1092 aa  108  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  36.93 
 
 		 752 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  33.91 
 
 		 1155 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  37.85 
 
 		 743 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  37.58 
 
 		 735 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  35.62 
 
 		 958 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  36.08 
 
 		 846 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  37.04 
 
 		 734 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  36.59 
 
 		 769 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  35.4 
 
 		 793 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  36.59 
 
 		 769 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  35.4 
 
 		 734 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>