299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1314 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  100 
 
 		 380 aa  778    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  58.29 
 
 		 390 aa  432  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  42.47 
 
 		 366 aa  289  6e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  41.53 
 
 		 375 aa  286  5e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  30.21 
 
 		 377 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  30.32 
 
 		 354 aa  139  7e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  29.15 
 
 		 409 aa  139  7e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  30.08 
 
 		 372 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  27.6 
 
 		 354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  28.91 
 
 		 478 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  29.82 
 
 		 483 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  28.45 
 
 		 377 aa  129  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  29 
 
 		 354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  29.21 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  26.12 
 
 		 429 aa  126  5e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  30.03 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  25.13 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  29.38 
 
 		 380 aa  124  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  26.4 
 
 		 356 aa  123  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  30.12 
 
 		 402 aa  119  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  27.71 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  26.74 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  28.45 
 
 		 361 aa  117  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  28.27 
 
 		 384 aa  116  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  30.97 
 
 		 383 aa  116  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  27.1 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  27.95 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  26.17 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  25.41 
 
 		 375 aa  110  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  25.82 
 
 		 373 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  27.89 
 
 		 397 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  27.3 
 
 		 427 aa  107  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  25.14 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  25.14 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  25.14 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  24.73 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2249  periplasmic binding protein  25.29 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  28.76 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  23.77 
 
 		 370 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  26.09 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2027  periplasmic binding protein  24.93 
 
 		 378 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4077  periplasmic binding protein  25.27 
 
 		 383 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  27.87 
 
 		 426 aa  97.4  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  23.31 
 
 		 377 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  25.07 
 
 		 375 aa  93.2  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  23.99 
 
 		 407 aa  92.8  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3900  periplasmic binding protein  24.87 
 
 		 386 aa  92.8  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2567  periplasmic binding protein  26.35 
 
 		 365 aa  90.9  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0204616  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  28.89 
 
 		 318 aa  90.1  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  23.12 
 
 		 371 aa  89.7  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  23.75 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  25 
 
 		 375 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1240  periplasmic binding protein  25.48 
 
 		 372 aa  87  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3035  periplasmic binding protein  26.89 
 
 		 372 aa  87  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  25.56 
 
 		 394 aa  86.7  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1701  periplasmic binding protein  27.37 
 
 		 365 aa  86.3  8e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  24.12 
 
 		 688 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  25.78 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  26.1 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.65 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  24.12 
 
 		 689 aa  83.6  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  25.98 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  25.82 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3531  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  23.1 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826718  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  25.2 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  25.61 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  24.94 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0797  periplasmic binding protein  25.14 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0161104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2207  periplasmic binding protein  29.06 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00190614  normal  0.612299 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2755  ABC transporter, substrate binding protein  23.97 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000138231  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  26.39 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  25.14 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  27.02 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1596  periplasmic binding protein  27.23 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  24.54 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  25 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1774  periplasmic binding protein  23.99 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  23.9 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1100  ABC transporter, substrate binding protein  25.82 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0595516  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  24.27 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  27.02 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2718  periplasmic binding protein  23.96 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  25.33 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  24.13 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1127  periplasmic binding protein  25.46 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1001  periplasmic binding protein  25.86 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  24.35 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2635  iron chelate ABC transporter periplasmic iron/siderophore-binding protein  26.03 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.97529e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  24.02 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2720  periplasmic binding protein  25.75 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000254593  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  24.29 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  22.8 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  25.94 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  25.13 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1708  periplasmic binding protein  23.44 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.56 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  22.26 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1693  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  22.83 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  26.86 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2805  periplasmic binding protein  23.32 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000505659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>