More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2651 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  94.03 
 
 		 492 aa  848    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 496 aa  984    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  72.36 
 
 		 527 aa  684    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  88.93 
 
 		 539 aa  819    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  88.93 
 
 		 499 aa  819    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  89.13 
 
 		 499 aa  822    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  30.68 
 
 		 506 aa  200  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  30.18 
 
 		 521 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  30.62 
 
 		 521 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  30.62 
 
 		 521 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  30.48 
 
 		 521 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  30.85 
 
 		 510 aa  189  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  33.03 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  31.45 
 
 		 503 aa  185  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  32.98 
 
 		 513 aa  177  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  30.26 
 
 		 538 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  30 
 
 		 547 aa  169  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  31.22 
 
 		 527 aa  167  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  27.72 
 
 		 528 aa  154  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  28.51 
 
 		 518 aa  153  8.999999999999999e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  33.09 
 
 		 519 aa  151  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  30.16 
 
 		 531 aa  150  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  28.82 
 
 		 519 aa  150  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  27.96 
 
 		 514 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  27.13 
 
 		 494 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  30.78 
 
 		 549 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  30.22 
 
 		 562 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 		 505 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  26.93 
 
 		 510 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 		 522 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  26.12 
 
 		 510 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 506 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  25.73 
 
 		 530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.86 
 
 		 542 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 486 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 486 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 486 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 520 aa  123  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  26.49 
 
 		 530 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  24.72 
 
 		 538 aa  120  4.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 		 514 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  26.79 
 
 		 543 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  28.46 
 
 		 516 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  26.68 
 
 		 570 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  27.39 
 
 		 515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  28.51 
 
 		 522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  28.47 
 
 		 483 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  28.47 
 
 		 483 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 505 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  29.07 
 
 		 497 aa  110  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  28.86 
 
 		 487 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.8 
 
 		 532 aa  108  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  27.66 
 
 		 523 aa  106  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64090  predicted protein  25.42 
 
 		 547 aa  106  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111826  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  23.14 
 
 		 571 aa  105  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 		 483 aa  105  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  26.52 
 
 		 496 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  26.62 
 
 		 544 aa  103  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  24.52 
 
 		 570 aa  101  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 		 483 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  26.54 
 
 		 514 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  23.39 
 
 		 526 aa  100  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  23.52 
 
 		 547 aa  99.4  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.32 
 
 		 527 aa  97.1  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 504 aa  93.6  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.76 
 
 		 532 aa  92.8  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  25.47 
 
 		 482 aa  90.5  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  25.47 
 
 		 482 aa  90.5  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  23.47 
 
 		 539 aa  89.4  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  24.73 
 
 		 455 aa  88.2  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  26.91 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  26.61 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  20.13 
 
 		 537 aa  83.2  0.000000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  27.5 
 
 		 725 aa  82.8  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.13 
 
 		 507 aa  82  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  25.07 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 		 494 aa  80.1  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  27.69 
 
 		 513 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  26.76 
 
 		 454 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 		 463 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  26.01 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05275  choline transporter, putative (Eurofung)  27.06 
 
 		 516 aa  77.8  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  21.82 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  20.48 
 
 		 495 aa  77  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  24.38 
 
 		 456 aa  77  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  23.15 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  23.77 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  23.09 
 
 		 449 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  23.77 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  23.77 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  23.53 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  23.77 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  23.77 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  27.89 
 
 		 489 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3995  amino acid permease-associated region  27.01 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140691  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  23.77 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  23.77 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  23.81 
 
 		 462 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3528  amino acid permease-associated region  27.01 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>