More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3587 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
255 aa  517  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435673  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1369  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.65 
 
 
260 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0037  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.25 
 
 
260 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0438  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.75 
 
 
256 aa  277  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.285603 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.45 
 
 
256 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.742718 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.85 
 
 
258 aa  271  9e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.236793 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.12 
 
 
256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.25 
 
 
288 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.69 
 
 
257 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.22 
 
 
266 aa  257  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.227086 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0503  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.6 
 
 
253 aa  255  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.61 
 
 
266 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359384  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0549  putative short-chain dehydrogenase/reductase, FabG-like  53.41 
 
 
266 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.204322  normal  0.437639 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.01 
 
 
264 aa  244  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.386853 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3706  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.61 
 
 
268 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.283086  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.88 
 
 
256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00640028  hitchhiker  0.00000248708 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.39 
 
 
271 aa  240  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.01 
 
 
258 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208357  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.48 
 
 
256 aa  239  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00682949  normal  0.0302653 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.48 
 
 
256 aa  239  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0224708  unclonable  0.0000202886 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.84 
 
 
254 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0761  putative oxidoreductase  45.85 
 
 
255 aa  237  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.429001 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51 
 
 
270 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00753595  normal  0.67708 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3483  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  50.2 
 
 
271 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.82 
 
 
254 aa  235  6e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.098133  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3445  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  50.2 
 
 
268 aa  234  8e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2483  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  50.2 
 
 
268 aa  234  8e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3480  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  50.2 
 
 
268 aa  234  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.538943  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3302  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  50.2 
 
 
268 aa  234  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1263  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  50.2 
 
 
268 aa  234  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0403  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  50.2 
 
 
268 aa  234  8e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.253369  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.27 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0597739  normal  0.690345 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.4 
 
 
251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1182  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  51.41 
 
 
271 aa  231  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0771  GntR family transcriptional regulator  47.27 
 
 
256 aa  231  7.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00515913  normal  0.0552536 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.09 
 
 
256 aa  230  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.138185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.81 
 
 
271 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0410788 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.81 
 
 
271 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.81 
 
 
271 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0853252  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1363  D-xylose dehydrogenase  49.19 
 
 
268 aa  228  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.879722  normal  0.999685 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 
257 aa  224  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.8 
 
 
261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132836  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.6 
 
 
270 aa  212  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304096  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51440  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  50.2 
 
 
260 aa  211  9e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
256 aa  207  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000241543 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.79 
 
 
258 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.58 
 
 
255 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.58 
 
 
255 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.13973  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
270 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.85 
 
 
261 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.59 
 
 
271 aa  198  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0225727  hitchhiker  0.000000282328 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.41 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.78 
 
 
259 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07128  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 
275 aa  182  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00131023  normal  0.0770254 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1729  D-xylose dehydrogenase  44.44 
 
 
245 aa  179  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.380531  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3666  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00136979  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4234  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 
252 aa  154  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
251 aa  151  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7060  short chain dehydrogenase  35.89 
 
 
255 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1335  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 
256 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0594  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 
256 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.512344  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2495  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 
256 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1500  short chain dehydrogenase  35.89 
 
 
256 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1235  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 
256 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0973  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 
256 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0318  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 
256 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.594764  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
257 aa  142  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1308  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 
256 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.480054  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4102  short chain dehydrogenase  36 
 
 
256 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.188504 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1106  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179926  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.25 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0357  putative short-chain dehydrogenase  34.66 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0963856  hitchhiker  0.00000797271 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0176  short chain dehydrogenase  35.48 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4567  short chain dehydrogenase  35.6 
 
 
256 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.16205  hitchhiker  0.000267636 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3963  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
251 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.680971  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3659  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 
256 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.821403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4708  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 
256 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.978516  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5592  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 
256 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0383111 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3985  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 
256 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.473882  normal  0.0186737 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
254 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
260 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  36.44 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 
269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09160  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
256 aa  135  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  36.84 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686827  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
252 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.11 
 
 
249 aa  132  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
256 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
256 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
236 aa  132  6.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  35.89 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745234  normal  0.0404538 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0293  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.678355  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>