More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0293 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0293  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 255 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.678355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 		 250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1946  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.5 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  40.65 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.024976  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.59 
 
 		 246 aa  158  8e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  38.62 
 
 		 253 aa  156  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.59 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.3 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 256 aa  155  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 		 256 aa  155  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  36.59 
 
 		 247 aa  155  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  41.06 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  36.18 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  39.52 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  39.36 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 250 aa  152  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 		 251 aa  152  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  40.24 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  39.43 
 
 		 253 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.41 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2690  short chain dehydrogenase  39.52 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  39.43 
 
 		 253 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1472  short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  36.05 
 
 		 282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0273044  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  37.4 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  36.58 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  36.58 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  36.58 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1518  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0138518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 251 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3471  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1634  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213832  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  35.02 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0890  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 		 281 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0865  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 		 265 aa  142  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  36.73 
 
 		 256 aa  142  7e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000927245  normal  0.0200652 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 		 282 aa  141  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.59 
 
 		 250 aa  141  9e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 250 aa  141  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3234  short chain dehydrogenase  40.15 
 
 		 257 aa  141  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.458923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2587  short chain dehydrogenase  40.93 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0972  putative short-chain dehydrogenase/reductase  38.2 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000126906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 		 255 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 		 258 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 		 255 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2281  short chain dehydrogenase  34.24 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03190  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  38 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4626  short chain dehydrogenase  38.31 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130325  normal  0.180414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4356  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 254 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 		 251 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4584  short chain dehydrogenase  38.67 
 
 		 252 aa  139  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.170316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 		 259 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1494  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000180405  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  36.11 
 
 		 257 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 253 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 		 251 aa  138  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 		 280 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1283  short-chain type dehydrogenase/reductase  34.39 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4827  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0477123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43180  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.165554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>