57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3251 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  567  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  44.09 
 
 		 262 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  46.78 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  35.93 
 
 		 268 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  36.03 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  33.08 
 
 		 273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  33.46 
 
 		 273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  35.06 
 
 		 240 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  35.22 
 
 		 240 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  36.22 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  34.15 
 
 		 245 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5219  periplasmic protein-like  29.03 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4903  periplasmic protein-like protein  26.61 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.96318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0811  hypothetical protein  32.32 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407181  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2694  periplasmic protein-like protein  30.12 
 
 		 576 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361508  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0091  hypothetical protein  26.29 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.164093  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1526  periplasmic protein-like protein  33.99 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0352336  normal  0.908264 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1810  hypothetical protein  24.86 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10680  hypothetical protein  32.05 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1514  periplasmic protein-like protein  28.33 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0326247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3657  periplasmic protein-like  27.96 
 
 		 417 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.568365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1220  putative secreted protein  27.75 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.789164  normal  0.0187345 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1411  periplasmic protein-like protein  26.72 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202803  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1327  hypothetical protein  28.22 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5203  hypothetical protein  25.79 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.297257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3874  hypothetical protein  27.41 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0974  hypothetical protein  28.92 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1106  hypothetical protein  25 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1655  hypothetical protein  27.54 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1613  hypothetical protein  27.91 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0837629  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  25.29 
 
 		 680 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2182  hypothetical protein  30.14 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  0.0204408 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2817  hypothetical protein  26.88 
 
 		 560 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3085  hypothetical protein  24.64 
 
 		 566 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1892  hypothetical protein  27.12 
 
 		 285 aa  52.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.769847 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3250  hypothetical protein  25.89 
 
 		 299 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334982  normal  0.501006 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  30.94 
 
 		 307 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  28.28 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5186  hypothetical protein  28.97 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3386  hypothetical protein  35.16 
 
 		 446 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3695  hypothetical protein  35.16 
 
 		 445 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.555947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1755  periplasmic protein-like protein  25.19 
 
 		 233 aa  49.3  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3116  hypothetical protein  28.39 
 
 		 322 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0789557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1850  periplasmic protein-like protein  36.07 
 
 		 351 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1489  hypothetical protein  30.63 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  0.0687577 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4146  hypothetical protein  27.04 
 
 		 537 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0847  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.32 
 
 		 1004 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4034  putative transmembrane protein  27.04 
 
 		 537 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1329  hypothetical protein  25.99 
 
 		 234 aa  46.2  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000146191  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1432  hypothetical protein  26.52 
 
 		 416 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441497 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3577  hypothetical protein  36.17 
 
 		 444 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3661  alpha/beta fold family hydrolase  24.29 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  27.97 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2400  periplasmic protein-like protein  23.57 
 
 		 215 aa  43.9  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1472  hypothetical protein  24.37 
 
 		 233 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00176011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  27.95 
 
 		 306 aa  42.7  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4663  hypothetical protein  26.92 
 
 		 481 aa  42  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>