More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1807 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1807  ABC transporter related  100 
 
 
367 aa  719    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0324794  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1163  ABC transporter related  68.77 
 
 
372 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0455034  normal  0.217765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  57.35 
 
 
373 aa  355  5.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  51.1 
 
 
365 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1341  ABC transporter related  46.02 
 
 
362 aa  289  6e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  46.8 
 
 
375 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  45.13 
 
 
371 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  52.46 
 
 
373 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  49.53 
 
 
363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  44.51 
 
 
364 aa  271  9e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2539  ABC transporter, ATPase subunit  44.54 
 
 
378 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.256647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1198  ABC transporter related  44.54 
 
 
378 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0576508 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.65 
 
 
367 aa  269  5e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1208  ABC transporter related  44.1 
 
 
364 aa  268  8e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.37 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  44.99 
 
 
389 aa  265  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  48.59 
 
 
357 aa  263  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0542  ABC transporter related  45.87 
 
 
370 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0569  ABC transporter related  45.62 
 
 
391 aa  246  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569114  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0578  ABC transporter related  46.01 
 
 
352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  49.43 
 
 
368 aa  237  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0178  ABC transporter related  47.99 
 
 
346 aa  237  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.360514 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0845  ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 
340 aa  236  3e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0243  ABC transporter  38.97 
 
 
340 aa  235  7e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  43.91 
 
 
342 aa  233  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  46.96 
 
 
342 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  42.12 
 
 
357 aa  232  9e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6287  ABC transporter related  47.23 
 
 
349 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  41.23 
 
 
389 aa  231  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  43.91 
 
 
355 aa  231  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  39.2 
 
 
342 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  41.37 
 
 
387 aa  229  6e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  45.11 
 
 
378 aa  229  7e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6773  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.51 
 
 
363 aa  228  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78331  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.69 
 
 
352 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  42.58 
 
 
375 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0811  ATPase  37.85 
 
 
352 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0326563  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  43.69 
 
 
342 aa  228  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0965  ABC transporter related  44.8 
 
 
343 aa  227  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.612494 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  37.94 
 
 
342 aa  226  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  41.41 
 
 
353 aa  225  9e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08641  ABC transporter ATP-binding protein  37.65 
 
 
352 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  39.76 
 
 
366 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07781  ABC transporter ATP-binding protein  37.1 
 
 
352 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  39.24 
 
 
349 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  43.75 
 
 
349 aa  223  6e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  45.55 
 
 
355 aa  222  7e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  41.18 
 
 
360 aa  222  7e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1904  ATP-binding component of putrescine transport system  41.05 
 
 
371 aa  222  8e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.188633  normal  0.381059 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  38.8 
 
 
354 aa  222  9e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  38.79 
 
 
342 aa  222  9e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  40.25 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  39.38 
 
 
343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  38.95 
 
 
349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  42.11 
 
 
363 aa  220  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  41.59 
 
 
329 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08671  ABC transporter ATP-binding protein  38.15 
 
 
352 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  38.66 
 
 
349 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  38.37 
 
 
349 aa  219  5e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.41 
 
 
329 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  38.26 
 
 
349 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 
349 aa  218  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  43.96 
 
 
371 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  44.02 
 
 
377 aa  216  4e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  42.09 
 
 
348 aa  216  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  42.62 
 
 
347 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  42.16 
 
 
343 aa  216  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  45.04 
 
 
366 aa  216  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  45.04 
 
 
333 aa  215  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  37.97 
 
 
349 aa  215  8e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  39.16 
 
 
356 aa  215  9e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  45.04 
 
 
333 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2376  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.96 
 
 
370 aa  215  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0669112  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  37.97 
 
 
349 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  43.63 
 
 
343 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1735  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.22 
 
 
368 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000353928 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  41.18 
 
 
378 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  45.49 
 
 
355 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  46.8 
 
 
390 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.75 
 
 
362 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  44.29 
 
 
329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.109279 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  44.63 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  40.06 
 
 
329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  42.59 
 
 
379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  44.63 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  44.63 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  43.97 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3117  ABC transporter-related protein  46.52 
 
 
353 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2519  ABC transporter related  41.28 
 
 
344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00672274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  44.21 
 
 
333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 
349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6379  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.76 
 
 
360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7192  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.42 
 
 
361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.27359  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.03 
 
 
354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  43.1 
 
 
352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  43.94 
 
 
329 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2861  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.63 
 
 
366 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527786  normal  0.0270955 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  45.26 
 
 
328 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4710  ABC transporter related  43 
 
 
359 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0388309 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1062  ABC transporter related protein  42.2 
 
 
373 aa  212  7e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>