More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2224 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2224  DNA polymerase I  100 
 
 		 846 aa  1721    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2285  DNA polymerase I  69.44 
 
 		 1273 aa  915    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153285  hitchhiker  0.0000116157 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  41.03 
 
 		 870 aa  623  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  39.84 
 
 		 893 aa  592  1e-167  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  39.93 
 
 		 893 aa  588  1e-166  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  40.97 
 
 		 924 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  38.75 
 
 		 878 aa  565  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  39.07 
 
 		 903 aa  567  1e-160  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  38.96 
 
 		 903 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  38.18 
 
 		 876 aa  565  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  37.54 
 
 		 877 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  38.18 
 
 		 876 aa  565  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  39.26 
 
 		 850 aa  560  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  37.53 
 
 		 877 aa  560  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  37.41 
 
 		 877 aa  559  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  37.41 
 
 		 891 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  37.41 
 
 		 891 aa  560  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  37.41 
 
 		 891 aa  560  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  37.09 
 
 		 877 aa  559  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  37.41 
 
 		 877 aa  559  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  37.95 
 
 		 876 aa  558  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  37.53 
 
 		 877 aa  558  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  37.41 
 
 		 877 aa  557  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  39.17 
 
 		 866 aa  558  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  37.64 
 
 		 877 aa  556  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  38.07 
 
 		 894 aa  553  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  38.63 
 
 		 883 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  39.69 
 
 		 897 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  41.42 
 
 		 868 aa  549  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  39.75 
 
 		 895 aa  546  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  37.44 
 
 		 872 aa  543  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  39.77 
 
 		 885 aa  544  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  39.69 
 
 		 897 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  39.58 
 
 		 897 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  40.41 
 
 		 878 aa  541  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  36.89 
 
 		 879 aa  536  1e-151  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  38.82 
 
 		 892 aa  538  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1666  DNA polymerase I  57.57 
 
 		 907 aa  536  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0551454 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  38.34 
 
 		 855 aa  536  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  38.81 
 
 		 902 aa  534  1e-150  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  39.6 
 
 		 892 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  37.8 
 
 		 936 aa  531  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  38.72 
 
 		 902 aa  531  1e-149  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  38.91 
 
 		 945 aa  529  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  38.24 
 
 		 906 aa  531  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  37.14 
 
 		 866 aa  531  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  37.05 
 
 		 896 aa  531  1e-149  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  36.8 
 
 		 866 aa  527  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  39.02 
 
 		 873 aa  523  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  39.49 
 
 		 884 aa  525  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  35.98 
 
 		 898 aa  523  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  38.56 
 
 		 888 aa  522  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  38.33 
 
 		 891 aa  522  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0048  DNA polymerase I  36.87 
 
 		 861 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  38.39 
 
 		 892 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  37.93 
 
 		 907 aa  511  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  37.47 
 
 		 877 aa  510  1e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  36.61 
 
 		 946 aa  511  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  37.49 
 
 		 885 aa  506  9.999999999999999e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  38.1 
 
 		 915 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  37.54 
 
 		 879 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  36.52 
 
 		 903 aa  504  1e-141  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0558  DNA polymerase I superfamily protein  35.05 
 
 		 908 aa  503  1e-141  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.101615  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1003  DNA polymerase I  36.69 
 
 		 858 aa  501  1e-140  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.842634  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  35.51 
 
 		 888 aa  499  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  37.16 
 
 		 929 aa  501  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  36.87 
 
 		 911 aa  500  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  36.36 
 
 		 880 aa  496  1e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2404  DNA polymerase I  39.29 
 
 		 845 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.405127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  37.72 
 
 		 905 aa  491  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  35.76 
 
 		 893 aa  489  1e-137  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  37.24 
 
 		 893 aa  487  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  34.89 
 
 		 890 aa  486  1e-136  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  37.11 
 
 		 905 aa  487  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  37.49 
 
 		 928 aa  484  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3450  DNA polymerase I  37.02 
 
 		 931 aa  485  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  35.78 
 
 		 932 aa  484  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1713  DNA polymerase I  37.41 
 
 		 872 aa  480  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  36.51 
 
 		 908 aa  481  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0558  DNA polymerase I  36.1 
 
 		 885 aa  479  1e-133  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.851525  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3125  DNA polymerase I  37.17 
 
 		 861 aa  473  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0497  DNA polymerase I  36.49 
 
 		 862 aa  471  1.0000000000000001e-131  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000090764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  37.4 
 
 		 886 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  35.59 
 
 		 941 aa  465  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  36.18 
 
 		 910 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2019  DNA polymerase I  34.83 
 
 		 885 aa  451  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.206031  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  34.14 
 
 		 955 aa  452  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1725  DNA polymerase I  33.94 
 
 		 875 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1705  DNA polymerase I  35.77 
 
 		 879 aa  449  1.0000000000000001e-124  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0229  DNA polymerase I  33.97 
 
 		 875 aa  449  1.0000000000000001e-124  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1103  DNA polymerase I  34.86 
 
 		 861 aa  443  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1802  DNA polymerase I  32.97 
 
 		 894 aa  444  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000838871 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1079  DNA polymerase I  36.62 
 
 		 836 aa  436  1e-120  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.26558  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0675  DNA polymerase I  33.17 
 
 		 829 aa  428  1e-118  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1341  DNA polymerase I  33.3 
 
 		 879 aa  427  1e-118  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  34.04 
 
 		 920 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  34.04 
 
 		 920 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  33.01 
 
 		 909 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1620  DNA polymerase I  32.47 
 
 		 879 aa  413  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  53.22 
 
 		 912 aa  416  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>