83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2068 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 285 aa  578  1e-164  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  32.21 
 
 		 273 aa  130  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  38.78 
 
 		 267 aa  126  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  36.17 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.6 
 
 		 271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  30.57 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1272  hypothetical protein  30.22 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.708188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  27.52 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0660  transcriptional regulator, MarR family  37.41 
 
 		 282 aa  94  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  32.68 
 
 		 253 aa  92.4  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  26.09 
 
 		 254 aa  92.4  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  31.69 
 
 		 237 aa  89.7  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 248 aa  89  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  26.73 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0650  hypothetical protein  31.16 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0654  hypothetical protein  29.71 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.997113  normal  0.803696 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  30.6 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 174 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  29.85 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2193  hypothetical protein  27.66 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.135571  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0340  regulatory protein, Crp  27.74 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.659624  normal  0.909155 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  31.69 
 
 		 485 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  27.07 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  23.97 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0944  transcriptional regulator, ArsR family  30.4 
 
 		 219 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0139266  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1645  ArsR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 166 aa  57.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1061  regulatory protein ArsR  27.94 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  29.01 
 
 		 167 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  29.23 
 
 		 176 aa  53.9  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1733  hypothetical protein  28.68 
 
 		 286 aa  52.8  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0103078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1281  ArsR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 154 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0435937 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  27.95 
 
 		 208 aa  49.7  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 103 aa  48.9  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  42.37 
 
 		 118 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  35.8 
 
 		 113 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3088  regulatory protein, ArsR  35.48 
 
 		 124 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 158 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1276  hypothetical protein  22.46 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121315 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  36.92 
 
 		 106 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 106 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6743  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 137 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.661837 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2687  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 175 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  40.98 
 
 		 97 aa  47  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1441  regulatory protein ArsR  34.78 
 
 		 145 aa  46.6  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 98 aa  46.6  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  37.7 
 
 		 104 aa  45.8  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 106 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  40.68 
 
 		 111 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 		 122 aa  45.4  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 155 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 106 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 106 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 106 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 104 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  38.98 
 
 		 107 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2275  ArsR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 105 aa  44.3  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03940  transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 		 98 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.621476  normal  0.0987714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  44.23 
 
 		 97 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 108 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 120 aa  44.3  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  35.94 
 
 		 109 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3096  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 		 121 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465743  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 103 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  34.43 
 
 		 117 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 106 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 118 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 103 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 98 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1230  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 330 aa  43.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  37.88 
 
 		 99 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2989  transcription regulator  26.77 
 
 		 204 aa  42.7  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2070  transcriptional regulator, TrmB  44 
 
 		 114 aa  42.7  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3238  Fis family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 127 aa  42.7  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3121  ArsR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 108 aa  42.7  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 291 aa  42.7  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 96 aa  42.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  42 
 
 		 121 aa  42.4  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 109 aa  42.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0725  transcriptional regulator, TrmB  48 
 
 		 117 aa  42  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.872668 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2240  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 214 aa  42  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.508848 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  37.7 
 
 		 107 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0304  ArsR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 110 aa  42  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00443787  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>