17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2240 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2240  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 214 aa  407  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.508848 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0951  transcriptional regulator, TrmB  65.27 
 
 		 207 aa  202  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0404  hypothetical protein  63.35 
 
 		 165 aa  198  6e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2091  transcriptional regulator, TrmB  53.49 
 
 		 234 aa  177  8e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0638  transcriptional regulator, TrmB  65.91 
 
 		 292 aa  175  6e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0575  transcriptional regulator, TrmB  39.29 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1502  transcriptional regulator, TrmB  41.86 
 
 		 131 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0976  transcriptional regulator, TrmB  40.52 
 
 		 132 aa  108  5e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0262  transcriptional regulator, TrmB  39.66 
 
 		 132 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1652  transcriptional regulator, TrmB  38.02 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.721567 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0425  transcriptional regulator, TrmB  38.76 
 
 		 135 aa  105  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.818854  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0352  transcriptional regulator, TrmB  36.76 
 
 		 135 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00150887 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0484  transcriptional regulator, TrmB  36.76 
 
 		 135 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.615252  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1567  transcriptional regulator, TrmB  36.76 
 
 		 135 aa  105  7e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0082  transcriptional regulator, TrmB  46.43 
 
 		 321 aa  45.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0320  transcriptional regulator, TrmB  35.79 
 
 		 127 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  40.74 
 
 		 285 aa  42.7  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>