14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0425 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0425  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 135 aa  267  5e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.818854  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0484  transcriptional regulator, TrmB  88.15 
 
 		 135 aa  235  1e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.615252  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1567  transcriptional regulator, TrmB  87.41 
 
 		 135 aa  234  4e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0352  transcriptional regulator, TrmB  86.67 
 
 		 135 aa  233  7e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00150887 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0575  transcriptional regulator, TrmB  63.91 
 
 		 196 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1502  transcriptional regulator, TrmB  68.14 
 
 		 131 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0976  transcriptional regulator, TrmB  64.06 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0262  transcriptional regulator, TrmB  64.06 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1652  transcriptional regulator, TrmB  67.24 
 
 		 132 aa  155  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.721567 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0404  hypothetical protein  44.44 
 
 		 165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0951  transcriptional regulator, TrmB  40.94 
 
 		 207 aa  114  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2240  transcriptional regulator, TrmB  38.76 
 
 		 214 aa  105  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.508848 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2091  transcriptional regulator, TrmB  41.04 
 
 		 234 aa  105  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0638  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 292 aa  104  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>