16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0951 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0951  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 207 aa  404  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2240  transcriptional regulator, TrmB  61.54 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.508848 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0404  hypothetical protein  59.21 
 
 		 165 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2091  transcriptional regulator, TrmB  67.67 
 
 		 234 aa  171  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0638  transcriptional regulator, TrmB  66.94 
 
 		 292 aa  161  6e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0575  transcriptional regulator, TrmB  42.65 
 
 		 196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1502  transcriptional regulator, TrmB  46.96 
 
 		 131 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0484  transcriptional regulator, TrmB  39.85 
 
 		 135 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.615252  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0352  transcriptional regulator, TrmB  39.85 
 
 		 135 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00150887 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1567  transcriptional regulator, TrmB  39.85 
 
 		 135 aa  115  6e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0425  transcriptional regulator, TrmB  40.94 
 
 		 135 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.818854  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0976  transcriptional regulator, TrmB  39.85 
 
 		 132 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1652  transcriptional regulator, TrmB  37.59 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.721567 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0262  transcriptional regulator, TrmB  37.12 
 
 		 132 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0320  transcriptional regulator, TrmB  34.02 
 
 		 127 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  34.33 
 
 		 231 aa  41.6  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>