14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2091 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2091  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 234 aa  455  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0638  transcriptional regulator, TrmB  81.88 
 
 		 292 aa  226  3e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0951  transcriptional regulator, TrmB  67.67 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2240  transcriptional regulator, TrmB  55.61 
 
 		 214 aa  169  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.508848 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0404  hypothetical protein  62.69 
 
 		 165 aa  158  8e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0425  transcriptional regulator, TrmB  41.04 
 
 		 135 aa  105  7e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.818854  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0352  transcriptional regulator, TrmB  40.3 
 
 		 135 aa  104  9e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00150887 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1567  transcriptional regulator, TrmB  39.55 
 
 		 135 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0484  transcriptional regulator, TrmB  38.81 
 
 		 135 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.615252  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1502  transcriptional regulator, TrmB  43.93 
 
 		 131 aa  102  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0575  transcriptional regulator, TrmB  43.93 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0976  transcriptional regulator, TrmB  42.06 
 
 		 132 aa  99  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1652  transcriptional regulator, TrmB  41.12 
 
 		 132 aa  97.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.721567 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0262  transcriptional regulator, TrmB  39.25 
 
 		 132 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>