73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4758 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  100 
 
 		 405 aa  835    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  51.12 
 
 		 370 aa  348  1e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  50.28 
 
 		 370 aa  339  4e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  50.72 
 
 		 359 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0969  integrase family protein  43.21 
 
 		 426 aa  249  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  40.44 
 
 		 367 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  38.69 
 
 		 389 aa  232  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  36.31 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0812  integrase family protein  38.44 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  39.83 
 
 		 346 aa  183  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7358  integrase family protein  40 
 
 		 344 aa  182  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0140  phage integrase family protein  33.73 
 
 		 375 aa  156  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0831  phage integrase family protein  33.23 
 
 		 362 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3065  phage integrase family protein  30.94 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.490306 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0826  phage integrase family protein  31.79 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2161  phage integrase family protein  29.47 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  30.03 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1951  phage-related integrase  29.46 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3849  phage integrase family protein  32.77 
 
 		 357 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0619  phage integrase family protein  33.88 
 
 		 389 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0676  phage integrase family protein  32.29 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1968  integrase/recombinase  32.29 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1076  integrase  35.48 
 
 		 250 aa  113  5e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2080  putative tyrosine recombinase  29.57 
 
 		 341 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.524732  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  27.86 
 
 		 359 aa  94  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2644  phage integrase family protein  27.56 
 
 		 335 aa  94  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00120469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  28.33 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  30.13 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3728  phage integrase family protein  25.97 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315534  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1662  integrase/recombinase  30.42 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0125485  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0961  phage integrase family protein  30.39 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178489  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  26.23 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1428  phage integrase family site specific recombinase  37.93 
 
 		 125 aa  68.6  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1474  phage integrase family site specific recombinase  35.66 
 
 		 164 aa  68.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  23.89 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  24.77 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  26.13 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0755  putative tyrosine recombinase  39.02 
 
 		 101 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313446  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0910  putative integrase  36.84 
 
 		 95 aa  58.9  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.690439  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  25.57 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3692  integrase family protein  35.16 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  25.6 
 
 		 335 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  26.42 
 
 		 311 aa  54.7  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  24.84 
 
 		 346 aa  54.3  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  29.41 
 
 		 197 aa  53.9  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  26.09 
 
 		 344 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  24.62 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0555  hypothetical protein  25.61 
 
 		 371 aa  51.6  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178247  normal  0.46728 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1692  phage integrase  24.74 
 
 		 348 aa  51.2  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  26.46 
 
 		 360 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  23.84 
 
 		 383 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1588  putative phage integrase/recombinase  43.75 
 
 		 66 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.497488  normal  0.399136 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  21.46 
 
 		 329 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  23.79 
 
 		 349 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  22.68 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  25.82 
 
 		 374 aa  47.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3569  phage integrase family protein  36.99 
 
 		 300 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal  0.0892176 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1133  integrase family protein  25.93 
 
 		 299 aa  46.6  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5643  tyrosine recombinase XerD  29.41 
 
 		 299 aa  46.6  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.776137 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4322  phage integrase family protein  27.7 
 
 		 193 aa  46.6  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205034  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  28.91 
 
 		 295 aa  46.2  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1238  integrase family protein  30.37 
 
 		 617 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.375916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2521  integrase family protein  30.37 
 
 		 617 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000524212  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.4 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  23.43 
 
 		 307 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  40.26 
 
 		 295 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1491  integrase family protein  24.47 
 
 		 273 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10711  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2653  integrase family protein  32.1 
 
 		 421 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534879  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0956  site-specific recombinase, phage integrase family  25.18 
 
 		 323 aa  43.5  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3501  integrase family protein  28.95 
 
 		 309 aa  43.1  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  28.47 
 
 		 338 aa  43.1  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  36.71 
 
 		 295 aa  43.1  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>