More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2465 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  100 
 
 
202 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  45.14 
 
 
194 aa  159  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  40.48 
 
 
187 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  38.5 
 
 
188 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  36.17 
 
 
196 aa  139  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  37.87 
 
 
190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  37.37 
 
 
188 aa  123  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  36.26 
 
 
191 aa  117  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  38.74 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  36.26 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  31.22 
 
 
345 aa  115  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  33.68 
 
 
191 aa  115  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  37.7 
 
 
188 aa  114  8.999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  36.41 
 
 
185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  35.26 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  38.22 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  34.59 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  37.17 
 
 
189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  33.9 
 
 
192 aa  109  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  33.33 
 
 
189 aa  108  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  35.5 
 
 
189 aa  104  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  33.33 
 
 
186 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  30.69 
 
 
183 aa  102  5e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  37.3 
 
 
184 aa  100  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  35.09 
 
 
166 aa  99.8  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  34.5 
 
 
166 aa  96.7  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  29.21 
 
 
252 aa  92  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  31.43 
 
 
169 aa  89  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  34.48 
 
 
167 aa  89  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  30.48 
 
 
166 aa  88.6  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  29.86 
 
 
334 aa  87.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  27.84 
 
 
245 aa  87.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  32.62 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  30.48 
 
 
186 aa  85.9  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  29.26 
 
 
176 aa  85.9  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  32.62 
 
 
171 aa  85.5  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  32.62 
 
 
171 aa  85.5  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  32.14 
 
 
169 aa  85.1  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  27.55 
 
 
190 aa  85.1  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  32.62 
 
 
180 aa  85.1  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2018  nitroreductase  31.64 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  30.18 
 
 
163 aa  84.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  31.46 
 
 
275 aa  84  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  28.8 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  30.81 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  30.29 
 
 
169 aa  84  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  30.64 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  29.35 
 
 
177 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  35.06 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  31.05 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.95 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  28.27 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  33.53 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  29.71 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0787  nitroreductase family protein  38.03 
 
 
177 aa  82  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0290068  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  28.57 
 
 
169 aa  82  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  31.07 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  24.47 
 
 
171 aa  80.9  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3446  nitroreductase  31.25 
 
 
184 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.19 
 
 
184 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  27.01 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  29.41 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  30.12 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  25.64 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  29.41 
 
 
169 aa  79  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  26.14 
 
 
173 aa  79  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  29.84 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  29.84 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  27.64 
 
 
274 aa  78.2  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  29.95 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  26.86 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  28.24 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  28.64 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  27.59 
 
 
171 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  27.27 
 
 
173 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  29.41 
 
 
178 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  26.14 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  30.11 
 
 
274 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  29.59 
 
 
170 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  32.9 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  28.93 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  29.35 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  28.16 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  28.16 
 
 
215 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  26.64 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  27.27 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  29.27 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  28.88 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  27.67 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  27.67 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  27.67 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  27.67 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  29.84 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  25.67 
 
 
163 aa  74.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  31.02 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0445  nitroreductase  28.49 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.861043  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  26.67 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  28.68 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  27.18 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  27.27 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>