More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0643 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  48.48 
 
 
702 aa  674    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  49.93 
 
 
732 aa  704    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  49.47 
 
 
702 aa  702    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  48.02 
 
 
701 aa  685    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  49.34 
 
 
729 aa  726    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  44.5 
 
 
1299 aa  670    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  49.54 
 
 
702 aa  702    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  48.22 
 
 
702 aa  676    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  43.62 
 
 
713 aa  642    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  47.96 
 
 
747 aa  647    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  49.41 
 
 
702 aa  713    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  47.8 
 
 
741 aa  739    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  100 
 
 
764 aa  1568    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  45.85 
 
 
773 aa  649    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  46.61 
 
 
691 aa  704    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  46.04 
 
 
726 aa  694    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  45.21 
 
 
704 aa  684    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  49.8 
 
 
702 aa  703    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  49.01 
 
 
702 aa  682    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  48.48 
 
 
702 aa  696    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  47.29 
 
 
738 aa  628  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  45.73 
 
 
732 aa  619  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  46.52 
 
 
739 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  42.46 
 
 
717 aa  609  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  45.41 
 
 
731 aa  611  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  46.81 
 
 
721 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  44.59 
 
 
739 aa  599  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  44.93 
 
 
739 aa  575  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  42.06 
 
 
687 aa  567  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  39.87 
 
 
753 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  41.39 
 
 
757 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  38.98 
 
 
733 aa  502  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  36.32 
 
 
725 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  35.8 
 
 
727 aa  432  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  35.76 
 
 
743 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  35.92 
 
 
733 aa  419  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  35.79 
 
 
715 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  34.08 
 
 
726 aa  392  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  45.09 
 
 
768 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  32.03 
 
 
720 aa  335  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  30.21 
 
 
721 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  30.21 
 
 
721 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  29.95 
 
 
721 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  29.85 
 
 
720 aa  300  6e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4198  formate dehydrogenase  30.29 
 
 
679 aa  238  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  26.91 
 
 
671 aa  228  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1073  molydopterin dinucleotide-binding region  28.15 
 
 
835 aa  195  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10199  oxidoreductase  26.68 
 
 
749 aa  191  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29998  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  27.11 
 
 
738 aa  187  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.05 
 
 
769 aa  185  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  25.33 
 
 
692 aa  183  9.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.59 
 
 
688 aa  182  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  27.36 
 
 
764 aa  183  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  27.36 
 
 
764 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  27.36 
 
 
764 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  28.63 
 
 
777 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.63 
 
 
777 aa  181  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.63 
 
 
804 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.63 
 
 
773 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2648  molybdopterin oxidoreductase  25.23 
 
 
747 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.63 
 
 
804 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  28.63 
 
 
804 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  27.11 
 
 
759 aa  181  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  27.86 
 
 
760 aa  180  7e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.63 
 
 
849 aa  180  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.69 
 
 
900 aa  180  9e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  28.6 
 
 
756 aa  179  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.31 
 
 
685 aa  177  5e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  25.13 
 
 
685 aa  177  9e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  29.45 
 
 
769 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  26.68 
 
 
760 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  30 
 
 
698 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  24.93 
 
 
747 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  26.3 
 
 
711 aa  173  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2859  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.29 
 
 
808 aa  173  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  25.25 
 
 
760 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  28.5 
 
 
715 aa  172  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  28.5 
 
 
715 aa  172  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  26.43 
 
 
760 aa  171  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  25.3 
 
 
758 aa  170  8e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.33 
 
 
715 aa  170  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  28.33 
 
 
715 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.33 
 
 
715 aa  169  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0320  Formate dehydrogenase  28.51 
 
 
700 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  26.67 
 
 
1135 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  28.33 
 
 
715 aa  169  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.09 
 
 
677 aa  169  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2860  molybdopterin oxidoreductase  28.31 
 
 
695 aa  169  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.73 
 
 
893 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.45 
 
 
927 aa  168  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  26.37 
 
 
760 aa  168  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  26.37 
 
 
764 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.6 
 
 
917 aa  167  5.9999999999999996e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  26.37 
 
 
764 aa  167  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  28.37 
 
 
695 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  27.08 
 
 
1143 aa  165  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  27.18 
 
 
750 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  25.29 
 
 
666 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2721  formate dehydrogenase  25.07 
 
 
752 aa  163  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.94379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2765  formate dehydrogenase  25.07 
 
 
752 aa  163  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>