More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1504 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1504  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0207643  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0366  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.43 
 
 
219 aa  311  6.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.925809  normal  0.0125175 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1553  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.51 
 
 
219 aa  308  5e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.575678  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0470  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  66.51 
 
 
219 aa  305  3e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0944397  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0439  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.68 
 
 
218 aa  281  6.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257833  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.83 
 
 
221 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.48 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.48 
 
 
214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.48 
 
 
214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.48 
 
 
214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.48 
 
 
214 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.48 
 
 
214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.48 
 
 
214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.48 
 
 
214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.01 
 
 
214 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.48 
 
 
214 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.48 
 
 
214 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.37 
 
 
218 aa  210  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.95 
 
 
231 aa  208  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.03 
 
 
219 aa  206  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  40.64 
 
 
220 aa  194  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.6 
 
 
227 aa  190  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  41.1 
 
 
224 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.13 
 
 
222 aa  187  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.39 
 
 
221 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.06 
 
 
218 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.15 
 
 
230 aa  185  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.86 
 
 
224 aa  185  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1858  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.76 
 
 
230 aa  185  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.67 
 
 
247 aa  184  7e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1028  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.76 
 
 
215 aa  184  8e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.198537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.47 
 
 
221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.59 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.47 
 
 
221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1306  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.54 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0153242  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.39 
 
 
218 aa  182  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1281  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.54 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.52 
 
 
232 aa  182  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1309  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.08 
 
 
215 aa  182  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.763619  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0861  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.81 
 
 
213 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.94 
 
 
221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.06 
 
 
221 aa  181  6e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.28 
 
 
221 aa  181  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0803  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.74 
 
 
221 aa  181  7e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.98 
 
 
216 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0480  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.2 
 
 
222 aa  181  8.000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0249327  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0626  Ribulose-phosphate 3-epimerase  43.93 
 
 
225 aa  181  8.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1857  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.81 
 
 
241 aa  180  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  normal  0.402345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.32 
 
 
221 aa  180  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.72 
 
 
223 aa  180  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1311  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.89 
 
 
240 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1509  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.06 
 
 
218 aa  181  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1167  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.32 
 
 
217 aa  180  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000257786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.79 
 
 
229 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1434  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.36 
 
 
220 aa  179  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.06 
 
 
223 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0914  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  41.82 
 
 
223 aa  178  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393455  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.47 
 
 
221 aa  177  8e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3105  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.35 
 
 
231 aa  177  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.486623  normal  0.395084 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  41.1 
 
 
224 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0788  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.86 
 
 
214 aa  177  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  41.1 
 
 
224 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0501  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.86 
 
 
215 aa  176  2e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.06 
 
 
217 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  41.31 
 
 
220 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.31 
 
 
220 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  41.12 
 
 
221 aa  176  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18110  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  40.19 
 
 
220 aa  176  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.562639 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3756  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.09 
 
 
225 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.2 
 
 
236 aa  175  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.28 
 
 
235 aa  174  7e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0476  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.86 
 
 
215 aa  174  7e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2043  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.84 
 
 
211 aa  174  7e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  41.47 
 
 
221 aa  174  9e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  41.4 
 
 
221 aa  173  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115968  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.16 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.74 
 
 
235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.59 
 
 
220 aa  172  1.9999999999999998e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1116  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.52 
 
 
220 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.91 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1014  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.52 
 
 
220 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3899  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.17 
 
 
228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.312657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.74 
 
 
234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.74 
 
 
234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1488  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.9 
 
 
215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2426  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.91 
 
 
224 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916461  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2385  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.91 
 
 
224 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2432  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.91 
 
 
224 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.67 
 
 
217 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.43 
 
 
221 aa  171  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1725  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.62 
 
 
220 aa  171  7.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0183458  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4153  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.39 
 
 
222 aa  170  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0034722  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2925  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.19 
 
 
219 aa  170  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.5 
 
 
220 aa  169  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2590  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.18 
 
 
234 aa  169  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0691249  normal  0.0209735 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1667  Ribulose-phosphate 3-epimerase  38.21 
 
 
226 aa  169  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.25106e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.28 
 
 
235 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5220  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.79 
 
 
216 aa  169  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238745  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2830  Ribulose-phosphate 3-epimerase  39.81 
 
 
218 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0833  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.86 
 
 
216 aa  169  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>