189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0407 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0407  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  816    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0240441  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0601  hypothetical protein  37.35 
 
 
433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.007011  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1352  hypothetical protein  36.64 
 
 
433 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.491685  hitchhiker  0.00000471163 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1324  hypothetical protein  34.28 
 
 
433 aa  223  4e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0193  hypothetical protein  33.65 
 
 
432 aa  195  1e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0000145617  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  21.17 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  26.67 
 
 
469 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  27.78 
 
 
443 aa  67.8  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  25.62 
 
 
448 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  24.36 
 
 
436 aa  63.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  27.94 
 
 
436 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  21.83 
 
 
450 aa  60.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  31.25 
 
 
323 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  23.94 
 
 
391 aa  58.9  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  25.19 
 
 
428 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  24.46 
 
 
412 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  21.08 
 
 
444 aa  57  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  22.31 
 
 
444 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  33.33 
 
 
322 aa  55.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  40.51 
 
 
297 aa  55.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  35.44 
 
 
295 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  44.23 
 
 
286 aa  55.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  22.99 
 
 
430 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  43.14 
 
 
290 aa  55.5  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  26.32 
 
 
309 aa  54.7  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  46.15 
 
 
312 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  21.94 
 
 
440 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  31.91 
 
 
309 aa  54.7  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  44.9 
 
 
316 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  39.24 
 
 
296 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  32.63 
 
 
291 aa  54.3  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  22.99 
 
 
446 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  25.64 
 
 
286 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  28 
 
 
324 aa  53.1  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  23.4 
 
 
430 aa  53.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  33.78 
 
 
311 aa  53.1  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  41.07 
 
 
286 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  42 
 
 
430 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  32.43 
 
 
317 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  29.47 
 
 
319 aa  52.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  42.5 
 
 
431 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  33.78 
 
 
318 aa  52.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  32.43 
 
 
317 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  32.43 
 
 
317 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  32.43 
 
 
317 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  36.71 
 
 
290 aa  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  24.63 
 
 
455 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  26.45 
 
 
473 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  37.66 
 
 
287 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  20.92 
 
 
436 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  41.18 
 
 
309 aa  52.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  27.56 
 
 
296 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  32.43 
 
 
317 aa  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  36.71 
 
 
328 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  30.77 
 
 
291 aa  51.6  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  24.59 
 
 
434 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  20.51 
 
 
429 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  40.38 
 
 
289 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  41.07 
 
 
292 aa  51.2  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  34.38 
 
 
303 aa  51.6  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  40.38 
 
 
289 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  40.38 
 
 
289 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  40.74 
 
 
294 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  40 
 
 
324 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  35.44 
 
 
302 aa  51.6  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  37.7 
 
 
432 aa  51.2  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  40 
 
 
454 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  36 
 
 
430 aa  50.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  40 
 
 
444 aa  50.4  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  23.7 
 
 
437 aa  50.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  22.7 
 
 
430 aa  50.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  39.58 
 
 
440 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1638  protein of unknown function DUF58  42.31 
 
 
241 aa  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.717641 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  23.36 
 
 
458 aa  49.7  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  39.58 
 
 
449 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  39.58 
 
 
449 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  39.58 
 
 
449 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  22.32 
 
 
296 aa  49.7  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  38 
 
 
441 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  31.08 
 
 
351 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  20.91 
 
 
447 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  43.14 
 
 
295 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  37.5 
 
 
433 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  24.19 
 
 
444 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  40.82 
 
 
328 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  40.82 
 
 
320 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  38.78 
 
 
335 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  31.58 
 
 
287 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  37.68 
 
 
302 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  40.74 
 
 
294 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  42.31 
 
 
292 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  37.68 
 
 
296 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  29.67 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  37.04 
 
 
320 aa  48.9  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  37.04 
 
 
309 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  27.45 
 
 
430 aa  48.9  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  31.08 
 
 
304 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  39.62 
 
 
300 aa  48.9  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  37.74 
 
 
331 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0823  protein of unknown function DUF58  25 
 
 
298 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>