94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0365 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  942    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  57.86 
 
 		 494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  57.8 
 
 		 504 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  49.67 
 
 		 466 aa  385  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  31.57 
 
 		 501 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  31.33 
 
 		 501 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  36.88 
 
 		 429 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  32.61 
 
 		 494 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  35.61 
 
 		 438 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  33.97 
 
 		 513 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  33.97 
 
 		 513 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  33.65 
 
 		 513 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  36.36 
 
 		 513 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  31.74 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  28.8 
 
 		 491 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  29.07 
 
 		 854 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  33.89 
 
 		 512 aa  97.1  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  36.52 
 
 		 461 aa  96.3  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  33.68 
 
 		 456 aa  94.4  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  32.07 
 
 		 495 aa  93.6  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  27.29 
 
 		 515 aa  92.8  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  31.38 
 
 		 495 aa  90.5  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  30.5 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  31.3 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  31.78 
 
 		 345 aa  73.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  30.77 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  30.69 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  27.88 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  31.44 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  27.45 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  28.78 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  28.92 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  30 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  28.68 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  27.82 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  28.51 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  27.63 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  26.47 
 
 		 1844 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  26.98 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  25.35 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  28.62 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  26.77 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.08 
 
 		 1016 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  27.76 
 
 		 451 aa  62.4  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.88 
 
 		 1027 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  27.44 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  28.66 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1841  hypothetical protein  27.72 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.09 
 
 		 657 aa  60.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  26.52 
 
 		 1175 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4785  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  28.5 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432202  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1793  putative signal peptide  28.22 
 
 		 448 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11444 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  24.69 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4474  hypothetical protein  28.29 
 
 		 330 aa  59.7  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  27.41 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1319  hypothetical protein  27 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.78 
 
 		 3977 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  24.74 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  28.1 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4103  hypothetical protein  27.72 
 
 		 451 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.901263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  27.13 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1723  hypothetical protein  26.73 
 
 		 464 aa  56.2  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.532519  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1281  hypothetical protein  25.26 
 
 		 458 aa  56.6  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  26.87 
 
 		 384 aa  56.6  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  27.37 
 
 		 451 aa  55.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  29.32 
 
 		 2852 aa  55.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  26.97 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3050  hypothetical protein  25.61 
 
 		 458 aa  54.7  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3903  hypothetical protein  26.73 
 
 		 451 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  27.27 
 
 		 404 aa  54.3  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  26.97 
 
 		 410 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3317  periplasmic protein  27.5 
 
 		 473 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  24.44 
 
 		 376 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  25.44 
 
 		 510 aa  52.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  27.11 
 
 		 998 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0371  hypothetical protein  24.01 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0107  hypothetical protein  22.97 
 
 		 448 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  25.57 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1224  hypothetical protein  24.01 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  26.7 
 
 		 448 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  25.49 
 
 		 452 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  26.77 
 
 		 344 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1247  hypothetical protein  26.26 
 
 		 452 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171773  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  24.71 
 
 		 388 aa  48.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0797  putative signal peptide protein  27.27 
 
 		 452 aa  47.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.532583 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  25.09 
 
 		 441 aa  47.8  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  25.78 
 
 		 441 aa  47.8  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  27.27 
 
 		 401 aa  47  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  24.46 
 
 		 699 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  26.29 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4733  hypothetical protein  25.25 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.65 
 
 		 769 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1100  hypothetical protein  26.26 
 
 		 452 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.63 
 
 		 1372 aa  43.9  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>