94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_04069 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  93.62 
 
 		 449 aa  833    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  100 
 
 		 424 aa  881    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  63.83 
 
 		 429 aa  545  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  40.14 
 
 		 411 aa  316  5e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  40.48 
 
 		 418 aa  286  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  33.42 
 
 		 418 aa  194  4e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  32.3 
 
 		 431 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  31.97 
 
 		 380 aa  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  33.65 
 
 		 444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  30.5 
 
 		 419 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  30.5 
 
 		 419 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  30.21 
 
 		 419 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  30.37 
 
 		 419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  32.04 
 
 		 391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  29.25 
 
 		 430 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  28.64 
 
 		 435 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  30.24 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  28.61 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  29.92 
 
 		 433 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  28.75 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  28.54 
 
 		 430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  28.5 
 
 		 435 aa  137  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  26.17 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  28.87 
 
 		 434 aa  130  6e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  27.51 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  25.93 
 
 		 433 aa  124  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  26.09 
 
 		 426 aa  123  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  24.47 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  26.99 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  26.81 
 
 		 407 aa  92.8  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  27.2 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  25.91 
 
 		 409 aa  89.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  26.01 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  27.18 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  28.12 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  26.74 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  26.2 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  26.28 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  25.79 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  28.13 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  25.51 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  27.69 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  23.36 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  25.58 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  26.24 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  26.98 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  26.49 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  23.75 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  24.42 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  26.17 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  28.01 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  28.71 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  24.47 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  26.36 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  24.62 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  30.22 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  24.87 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  24.29 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  25.06 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4194  hypothetical protein  54.72 
 
 		 120 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.323194 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  25.68 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  27.06 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  25.79 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  24.75 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  25.73 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  23.47 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  26.6 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  30.77 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  26.02 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  26.53 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  25.07 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  25.34 
 
 		 440 aa  53.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  24.19 
 
 		 330 aa  50.4  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  26.48 
 
 		 431 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  26.67 
 
 		 430 aa  50.1  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  27.27 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3446  HipA domain-containing protein  27.72 
 
 		 617 aa  46.2  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  35 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  29.37 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  30.14 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  29.79 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  26.77 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  29.75 
 
 		 450 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0502  hypothetical protein  27.84 
 
 		 430 aa  43.9  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  37.35 
 
 		 460 aa  43.5  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  44 
 
 		 433 aa  43.5  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  29.29 
 
 		 396 aa  43.5  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  27.14 
 
 		 434 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  42 
 
 		 433 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  42 
 
 		 433 aa  43.1  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  42 
 
 		 433 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  42 
 
 		 423 aa  43.1  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  29.75 
 
 		 450 aa  43.1  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>