More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02665 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  40.63 
 
 		 1015 aa  742    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  43.05 
 
 		 1019 aa  837    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  42.36 
 
 		 1024 aa  789    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  41.53 
 
 		 1028 aa  777    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  38.77 
 
 		 1009 aa  731    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  43.14 
 
 		 1021 aa  814    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  42 
 
 		 1029 aa  774    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  39.08 
 
 		 1014 aa  665    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  42.2 
 
 		 1029 aa  773    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3642  acriflavin resistance protein  42.13 
 
 		 1028 aa  739    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622959  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  43.33 
 
 		 1019 aa  851    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  42.08 
 
 		 1036 aa  784    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  42.09 
 
 		 1010 aa  795    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  39.57 
 
 		 1019 aa  738    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  42 
 
 		 1025 aa  797    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  42 
 
 		 1036 aa  786    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  41.72 
 
 		 1028 aa  795    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  38.46 
 
 		 1017 aa  684    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  39.02 
 
 		 1016 aa  726    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  41.41 
 
 		 1023 aa  780    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  39.84 
 
 		 1017 aa  663    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  37.22 
 
 		 1040 aa  682    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02665  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family protein  100 
 
 		 1013 aa  2052    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  47.45 
 
 		 1016 aa  885    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  42 
 
 		 1024 aa  796    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  42.06 
 
 		 1028 aa  803    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  46.24 
 
 		 1014 aa  859    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  42 
 
 		 1029 aa  774    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  41.9 
 
 		 1029 aa  768    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1419  acriflavin resistance protein  40.43 
 
 		 1016 aa  698    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  42.3 
 
 		 1029 aa  763    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  42.3 
 
 		 1029 aa  763    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  42.51 
 
 		 1025 aa  795    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  42.25 
 
 		 1032 aa  782    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  42.3 
 
 		 1027 aa  772    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  42.52 
 
 		 1021 aa  786    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3512  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  42.13 
 
 		 1028 aa  739    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270807  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  42.68 
 
 		 1029 aa  790    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  41.44 
 
 		 1020 aa  759    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2116  acriflavin resistance protein  46.37 
 
 		 1043 aa  875    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0848  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  42.03 
 
 		 1028 aa  734    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.377805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  36.9 
 
 		 1056 aa  666    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  40.9 
 
 		 1041 aa  745    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  38.71 
 
 		 1013 aa  682    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3993  AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter  40.47 
 
 		 1025 aa  744    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  41.98 
 
 		 1027 aa  763    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  36.3 
 
 		 1013 aa  608  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  36.63 
 
 		 1012 aa  598  1e-169  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  35.23 
 
 		 1027 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  34.22 
 
 		 1020 aa  572  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  32.94 
 
 		 1035 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  32.84 
 
 		 1035 aa  561  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.01 
 
 		 1019 aa  535  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  32.65 
 
 		 1035 aa  535  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  32.43 
 
 		 1025 aa  520  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  32.68 
 
 		 1044 aa  519  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  31.38 
 
 		 1046 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1047  acriflavin resistance protein  31.23 
 
 		 1021 aa  500  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0882711 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  31.49 
 
 		 1039 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  31.43 
 
 		 1039 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  31.47 
 
 		 1022 aa  498  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  30.38 
 
 		 1050 aa  497  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  30.66 
 
 		 1046 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  30.5 
 
 		 1023 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  31.26 
 
 		 1039 aa  491  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5191  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.4 
 
 		 1033 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0914  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  29.84 
 
 		 1024 aa  489  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  30.15 
 
 		 1019 aa  487  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1101  acriflavin resistance protein  30.7 
 
 		 1044 aa  488  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.312042 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  32.2 
 
 		 1019 aa  487  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  30.37 
 
 		 1048 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  30.36 
 
 		 1067 aa  488  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0857  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  29.84 
 
 		 1024 aa  487  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634925  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1453  acriflavin resistance protein  29.28 
 
 		 1031 aa  486  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3465  RND family efflux transporter MFP subunit  30.58 
 
 		 1017 aa  486  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0968249  normal  0.0910855 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  32.59 
 
 		 1053 aa  484  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0346  acriflavin resistance protein  30.2 
 
 		 1033 aa  485  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463881  normal  0.463226 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5080  acriflavin resistance protein  30.38 
 
 		 1017 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.373906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5173  acriflavin resistance protein  30.18 
 
 		 1017 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.181965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  31.49 
 
 		 1031 aa  480  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  30.08 
 
 		 1047 aa  483  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4339  acriflavin resistance protein  30.06 
 
 		 1020 aa  481  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.207307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  31.4 
 
 		 1051 aa  482  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  29.15 
 
 		 1023 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4708  acriflavin resistance protein  30.09 
 
 		 1020 aa  481  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.556784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4856  acriflavin resistance protein  30.23 
 
 		 1023 aa  478  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287166  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  30.34 
 
 		 1045 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  30.02 
 
 		 1047 aa  476  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0734  acriflavin resistance protein  30.02 
 
 		 1035 aa  479  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.91 
 
 		 1027 aa  473  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2959  acriflavin resistance protein  30.22 
 
 		 1071 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263635 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  30.46 
 
 		 1041 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0289  acriflavin resistance protein  29.78 
 
 		 1021 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.461457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  31.71 
 
 		 1041 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  31.52 
 
 		 1036 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2039  RND family mulitdrug efflux protein  29.19 
 
 		 1025 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  29.87 
 
 		 1018 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  29.87 
 
 		 1046 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  30.55 
 
 		 1049 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  31.43 
 
 		 1022 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>