218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02557 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  100 
 
 
687 aa  1416    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  34.65 
 
 
667 aa  300  6e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  33.27 
 
 
691 aa  298  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  34.16 
 
 
680 aa  298  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  33.45 
 
 
689 aa  293  5e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  32.3 
 
 
732 aa  293  8e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  32.99 
 
 
715 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  32.2 
 
 
689 aa  290  9e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  33.62 
 
 
674 aa  287  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  33.43 
 
 
715 aa  286  7e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  33.53 
 
 
715 aa  286  8e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  35.36 
 
 
660 aa  285  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  31.63 
 
 
662 aa  281  4e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  30.37 
 
 
754 aa  277  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  32.55 
 
 
667 aa  275  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  34.24 
 
 
707 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
709 aa  268  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  32.06 
 
 
730 aa  263  6e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  33.51 
 
 
641 aa  262  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  31.42 
 
 
661 aa  261  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  32.79 
 
 
734 aa  256  8e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  32.79 
 
 
734 aa  256  9e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  30.36 
 
 
696 aa  254  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  32.74 
 
 
739 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  32.74 
 
 
739 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  30.92 
 
 
683 aa  249  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  32.5 
 
 
669 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  31.47 
 
 
767 aa  248  3e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  30.2 
 
 
668 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  31.6 
 
 
767 aa  243  6e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  33.82 
 
 
662 aa  238  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  31.46 
 
 
653 aa  229  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  30.27 
 
 
645 aa  225  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  32.2 
 
 
656 aa  223  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  32.98 
 
 
681 aa  219  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  32.66 
 
 
645 aa  218  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  32.5 
 
 
705 aa  218  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  32.49 
 
 
671 aa  217  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  32.36 
 
 
676 aa  214  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  35.29 
 
 
674 aa  207  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  35.29 
 
 
674 aa  207  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  29.08 
 
 
673 aa  193  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  27.22 
 
 
680 aa  191  5e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  26.89 
 
 
662 aa  190  8e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  34.86 
 
 
943 aa  187  8e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  28.75 
 
 
684 aa  182  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  27.96 
 
 
662 aa  178  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  30.34 
 
 
676 aa  173  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  26.09 
 
 
688 aa  172  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  31.58 
 
 
706 aa  172  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  26.23 
 
 
688 aa  172  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  28.15 
 
 
689 aa  169  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  29.77 
 
 
673 aa  168  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  29.64 
 
 
635 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  30.52 
 
 
698 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  29.04 
 
 
649 aa  163  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  29.56 
 
 
685 aa  158  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  30.75 
 
 
672 aa  154  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  30.71 
 
 
668 aa  152  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  28.64 
 
 
726 aa  151  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  27.98 
 
 
685 aa  145  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  27.43 
 
 
685 aa  144  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  27.04 
 
 
692 aa  125  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  27.97 
 
 
633 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  25.34 
 
 
634 aa  121  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  22.35 
 
 
631 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  23 
 
 
744 aa  107  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  25.65 
 
 
644 aa  106  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  23.16 
 
 
637 aa  104  6e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  24.83 
 
 
639 aa  103  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  24.94 
 
 
730 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  24.94 
 
 
632 aa  102  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  25.25 
 
 
632 aa  102  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  25.06 
 
 
644 aa  98.2  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  24.72 
 
 
634 aa  96.3  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  28.28 
 
 
737 aa  93.6  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  37.8 
 
 
800 aa  90.5  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4603  transglutaminase domain-containing protein  24.18 
 
 
764 aa  90.1  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  26.67 
 
 
800 aa  84.7  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  21.84 
 
 
720 aa  84  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  33.12 
 
 
760 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  23.3 
 
 
728 aa  82  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  26.42 
 
 
788 aa  81.6  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  35.9 
 
 
790 aa  80.1  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  26.62 
 
 
840 aa  77.4  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  26.49 
 
 
782 aa  77.4  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  25.28 
 
 
812 aa  77.4  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  27.89 
 
 
736 aa  77  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  27.6 
 
 
673 aa  77  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  35.34 
 
 
806 aa  77  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  22.03 
 
 
742 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  24.12 
 
 
742 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  22.03 
 
 
742 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  23.67 
 
 
742 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  22.82 
 
 
742 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  36.89 
 
 
730 aa  74.7  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  23.1 
 
 
742 aa  74.7  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  32.79 
 
 
890 aa  74.3  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  45.36 
 
 
706 aa  73.6  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  53.03 
 
 
792 aa  72.8  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>