More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5037 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  83.8 
 
 		 216 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  49.5 
 
 		 238 aa  174  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  49.5 
 
 		 240 aa  174  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 258 aa  167  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  43.63 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0544  GntR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1023  GntR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0982  GntR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 226 aa  165  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0526617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  45 
 
 		 249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2372  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 226 aa  154  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  40.5 
 
 		 231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  35.81 
 
 		 223 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 255 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  38.94 
 
 		 224 aa  111  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  33.82 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  39.15 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 254 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 231 aa  98.6  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  98.2  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 223 aa  98.2  9e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 245 aa  98.2  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  34.56 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 215 aa  96.7  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 220 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2211  transcriptional regulator, GntR family  38.51 
 
 		 222 aa  95.5  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153172  decreased coverage  0.00038585 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 235 aa  95.5  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  33.84 
 
 		 228 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 235 aa  95.5  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1109  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 215 aa  94.7  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 230 aa  94.7  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  34.9 
 
 		 265 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3658  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5269  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 235 aa  94  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590842  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1795  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.79 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3224  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4266  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1728  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 231 aa  92.8  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.414703  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 253 aa  92.8  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 244 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 256 aa  92.8  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 233 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 247 aa  92.4  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  25.39 
 
 		 215 aa  91.7  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  35.42 
 
 		 240 aa  91.7  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  36.18 
 
 		 293 aa  91.7  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8055  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 244 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3761  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  36.82 
 
 		 240 aa  90.1  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  34.34 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 244 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3327  GntR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 250 aa  89.4  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 245 aa  89.4  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 238 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 243 aa  89  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 238 aa  88.2  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 232 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  32.67 
 
 		 228 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  32.83 
 
 		 246 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 238 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3321  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  86.7  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.216307  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5794  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.499675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 260 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6491  transcriptional regulator, GntR family  35.79 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3597  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>