176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2201 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  99.62 
 
 		 266 aa  521  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  100 
 
 		 264 aa  523  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  38.58 
 
 		 251 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  37.55 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  34.6 
 
 		 214 aa  116  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  40.62 
 
 		 252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  41.21 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  36.84 
 
 		 256 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  36.96 
 
 		 262 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  38.5 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  31.85 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  32.45 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  32.02 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  35.86 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  32.56 
 
 		 280 aa  98.6  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  40.31 
 
 		 247 aa  96.3  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  36.92 
 
 		 251 aa  95.5  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  35.27 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  35.75 
 
 		 259 aa  92.8  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  39.53 
 
 		 253 aa  92  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  34.82 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  32.74 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  44.2 
 
 		 259 aa  89.4  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  33.18 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  38.89 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  35.29 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  32.02 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  34.82 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  33.86 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  34.34 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  31.2 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  36.63 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  32.31 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  34.12 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  33.49 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  31.02 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  37.93 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  33.65 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  32.97 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  32.14 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  36 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  32.14 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  40.83 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  32.57 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  34.26 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  36.92 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  37.56 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  36.92 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  35.9 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  30.09 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  33.2 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  29.41 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  31.06 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  30.13 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  36.73 
 
 		 264 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  33.49 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  38.27 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  28.88 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  29.55 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  34.53 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1507  hypothetical protein  29.33 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  29.91 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  29.49 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1471  hypothetical protein  29.33 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  36.23 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  33.94 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  28.85 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2682  hypothetical protein  31.34 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566632  unclonable  0.000043441 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  29.13 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  30.12 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  29 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  28.4 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2615  hypothetical protein  30.85 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175692  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2230  hypothetical protein  30.84 
 
 		 245 aa  65.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.951055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  29.49 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  35.03 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  33.5 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  28.51 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  28.68 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2935  hypothetical protein  34.66 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  33.17 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  28.88 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  28.57 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1189  hypothetical protein  26.46 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  30.6 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  28.57 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  28.57 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  32.04 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  28.57 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  32.13 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  31.82 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2789  hypothetical protein  31.31 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  32.05 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  28.08 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  32.11 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  37.5 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  39.53 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1372  hypothetical protein  32.21 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651893  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  29.82 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  32.11 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>