133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0421 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0421  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 182 aa  369  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0758  transcriptional regulator  27.61 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000100978  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0483  transcriptional regulator  27.61 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000428437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  38.89 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 205 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03830  transcriptional regulator, tetR family  36.99 
 
 		 193 aa  52.4  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  30.97 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  30.34 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 235 aa  50.4  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  25.13 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  25.13 
 
 		 184 aa  48.1  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24160  hypothetical protein  29.37 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 230 aa  48.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 202 aa  47.8  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  26.09 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  32.43 
 
 		 248 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3329  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0147538 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24500  transcriptional regulator  33.93 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  22.53 
 
 		 212 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 205 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 211 aa  45.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  40 
 
 		 190 aa  45.4  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  25.45 
 
 		 201 aa  45.4  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 194 aa  45.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 205 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 191 aa  45.1  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 205 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 178 aa  44.7  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 194 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 205 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 251 aa  44.3  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 227 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2558  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21540  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3666  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  24.59 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  20.51 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0774  transcriptional regulator, TetR family  23.75 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 226 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0611  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  37.29 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 221 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 209 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 234 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 228 aa  42.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  21.15 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22230  transcriptional regulator  41.51 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.158788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 243 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 207 aa  42.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  25.68 
 
 		 207 aa  42.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  21.76 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 234 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 209 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  32 
 
 		 199 aa  42.4  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0212  transcriptional regulator, TetR family  21.15 
 
 		 187 aa  42  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>