More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2025 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2025  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  100 
 
 		 145 aa  290  5e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.404672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  49.66 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  48.28 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  43.75 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  48.57 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  48.57 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  44.44 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  46.81 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  44.44 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  43.75 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  43.75 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  43.75 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  43.75 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  43.75 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  43.75 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  43.75 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  43.75 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  43.06 
 
 		 152 aa  133  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  45.89 
 
 		 162 aa  132  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  41.67 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  44.83 
 
 		 149 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  43.75 
 
 		 148 aa  123  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  40.28 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  42.38 
 
 		 165 aa  111  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  42.67 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  40.14 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 155 aa  96.7  9e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 154 aa  94.4  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36.24 
 
 		 164 aa  94.4  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1169  UspA family nucleotide-binding protein  39.44 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0164602  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0631  UspA family nucleotide-binding protein  37.06 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.25 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  33.77 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.77 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  29.01 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  26.62 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  34.29 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  32.39 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  34.04 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  28.12 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  28.12 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  31.25 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1284  UspA family nucleotide-binding protein  34.51 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.176075  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  31.37 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  31.37 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  27.78 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0180  UspA domain protein  29.45 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.242763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D31  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.97 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.575009  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  30.61 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  30.71 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  30.56 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19770  universal stress protein UspA-like protein  27.4 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.078994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  30.5 
 
 		 287 aa  61.6  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  27.66 
 
 		 288 aa  62  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  33.8 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  32.89 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  34.27 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  27.85 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  32.03 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  30.71 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1794  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.07 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  31.21 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  27.16 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10100  universal stress protein UspA-like protein  28.17 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23226  hitchhiker  0.0000145361 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  27.27 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11652  hypothetical protein  33.78 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.615716 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  29.73 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.41 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  27.21 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  28.39 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  29.37 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  28.95 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  28.37 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  30.72 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  29.49 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  30.72 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  31.51 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  34.46 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  28.86 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  28.39 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>