More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3051 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3051  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 684 aa  1333    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1996  protein-export membrane protein SecD  50.7 
 
 		 670 aa  566  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.391205  normal  0.0633632 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17550  protein-export membrane protein SecD  49.68 
 
 		 714 aa  558  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.122587 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1366  protein-export membrane protein SecD  43.96 
 
 		 620 aa  478  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15310  protein-export membrane protein SecD  44.65 
 
 		 640 aa  432  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.540675  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1798  protein-export membrane protein SecD  52.88 
 
 		 606 aa  431  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.427171  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6109  Preprotein translocase subunit SecD-like protein  42.25 
 
 		 581 aa  402  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2299  preprotein translocase subunit SecD  47.44 
 
 		 585 aa  391  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2113  protein-export membrane protein SecD  41.97 
 
 		 584 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110466  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13980  protein-export membrane protein SecD  40.03 
 
 		 661 aa  384  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1373  preprotein translocase subunit SecD  40.92 
 
 		 607 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2389  preprotein translocase subunit SecD  40.1 
 
 		 564 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1670  protein-export membrane protein SecD  51.74 
 
 		 635 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2029  preprotein translocase subunit SecD  47.24 
 
 		 585 aa  359  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000877869 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15100  protein-export membrane protein SecD  38.77 
 
 		 603 aa  339  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12860  protein-export membrane protein SecD  45.82 
 
 		 620 aa  319  1e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.258671  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2356  protein-export membrane protein SecD  45.5 
 
 		 674 aa  315  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1812  protein-export membrane protein SecD  37.27 
 
 		 666 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2061  protein-export membrane protein SecD  48.56 
 
 		 547 aa  311  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.789489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1695  protein-export membrane protein SecD  39.21 
 
 		 632 aa  310  5.9999999999999995e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1341  preprotein translocase subunit SecD  49.57 
 
 		 605 aa  307  4.0000000000000004e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.022847  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1802  protein-export membrane protein SecD  35.5 
 
 		 653 aa  293  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.414477  decreased coverage  0.00000714928 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3174  protein-export membrane protein SecD  46.65 
 
 		 566 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.761403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3824  protein-export membrane protein SecD  40.44 
 
 		 656 aa  258  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3391  protein-export membrane protein SecD  44.41 
 
 		 649 aa  254  5.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000226578  hitchhiker  0.0000733205 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1942  protein-export membrane protein SecD  42.09 
 
 		 538 aa  250  6e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0269026  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2304  protein-export membrane protein SecD  45.63 
 
 		 550 aa  244  5e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3816  preprotein translocase subunit SecD  47.56 
 
 		 617 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258625  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2583  preprotein translocase subunit SecD  46.01 
 
 		 599 aa  228  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321622  normal  0.917688 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12607  preprotein translocase subunit SecD  45.54 
 
 		 573 aa  209  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.455392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2276  preprotein translocase subunit SecD  45.34 
 
 		 598 aa  206  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2323  preprotein translocase subunit SecD  45.34 
 
 		 598 aa  206  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388488  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2315  preprotein translocase subunit SecD  45.34 
 
 		 598 aa  206  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534551  normal  0.509852 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  30.17 
 
 		 989 aa  194  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0945  protein-export membrane protein SecD  39.48 
 
 		 496 aa  189  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  34.81 
 
 		 977 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  37.84 
 
 		 533 aa  153  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  36.02 
 
 		 534 aa  152  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  37.77 
 
 		 900 aa  152  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  37.76 
 
 		 533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  36.24 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  35.74 
 
 		 532 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  35.74 
 
 		 533 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  35.62 
 
 		 489 aa  146  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  36.36 
 
 		 531 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  38.1 
 
 		 533 aa  145  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  34.72 
 
 		 495 aa  145  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.04 
 
 		 853 aa  144  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  39.3 
 
 		 855 aa  144  5e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  40.43 
 
 		 464 aa  144  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  35.38 
 
 		 489 aa  144  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  34.03 
 
 		 495 aa  143  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  37.73 
 
 		 533 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  30.1 
 
 		 487 aa  143  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  34.23 
 
 		 487 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  35.38 
 
 		 489 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  33.44 
 
 		 493 aa  141  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.42 
 
 		 849 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  35.43 
 
 		 403 aa  140  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.23 
 
 		 848 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  34.75 
 
 		 525 aa  137  8e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  36.01 
 
 		 531 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.13 
 
 		 856 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  36.29 
 
 		 461 aa  135  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  35.61 
 
 		 535 aa  134  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  35.47 
 
 		 532 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  35.66 
 
 		 532 aa  134  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  36.57 
 
 		 535 aa  134  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  35.34 
 
 		 470 aa  134  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 486 aa  134  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  35.1 
 
 		 531 aa  133  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  34.6 
 
 		 613 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  33.86 
 
 		 537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  35.71 
 
 		 554 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  34.6 
 
 		 613 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  34.64 
 
 		 457 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  31.33 
 
 		 406 aa  130  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  34.85 
 
 		 474 aa  130  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  32.07 
 
 		 445 aa  130  8.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000019832  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  34.12 
 
 		 613 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  33.08 
 
 		 530 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  33.6 
 
 		 532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  36.33 
 
 		 470 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2102  protein-export membrane protein SecD  35.82 
 
 		 433 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.459213  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.01 
 
 		 990 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  36.33 
 
 		 470 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  33.57 
 
 		 735 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  35.74 
 
 		 471 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  32.62 
 
 		 441 aa  128  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000245038  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  33.08 
 
 		 533 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  32.29 
 
 		 472 aa  128  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  35.83 
 
 		 461 aa  127  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  33.97 
 
 		 532 aa  127  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0067  protein-export membrane protein SecD  32.45 
 
 		 465 aa  127  5e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  32.79 
 
 		 532 aa  127  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  33.6 
 
 		 554 aa  126  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  35.69 
 
 		 530 aa  126  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  31.71 
 
 		 530 aa  126  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0067  protein-export membrane protein SecD  32.81 
 
 		 465 aa  125  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1899  protein-export membrane protein SecD  34.88 
 
 		 551 aa  125  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680962  normal  0.478196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>