More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3013 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3013  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 366 aa  722    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1835  3-dehydroquinate synthase  75.07 
 
 		 373 aa  530  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  70.17 
 
 		 363 aa  515  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2021  3-dehydroquinate synthase  73.65 
 
 		 370 aa  506  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.990757  normal  0.0317478 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  72.16 
 
 		 577 aa  503  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  68.26 
 
 		 370 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17870  3-dehydroquinate synthase  67.58 
 
 		 395 aa  486  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.092005  normal  0.568716 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1334  3-dehydroquinate synthase  69.53 
 
 		 380 aa  481  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.904489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2272  3-dehydroquinate synthase  70.14 
 
 		 363 aa  480  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12660  3-dehydroquinate synthase  68.31 
 
 		 389 aa  459  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.3799  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  64.71 
 
 		 368 aa  448  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4296  3-dehydroquinate synthase  63.97 
 
 		 371 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.67949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  62.89 
 
 		 358 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15030  3-dehydroquinate synthase  61.56 
 
 		 360 aa  418  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0034705  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  60.22 
 
 		 368 aa  416  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  62.32 
 
 		 358 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2616  3-dehydroquinate synthase  59.94 
 
 		 371 aa  417  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  60.91 
 
 		 358 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5253  3-dehydroquinate synthase  63.69 
 
 		 368 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.528317  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2647  3-dehydroquinate synthase  61.41 
 
 		 359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3756  3-dehydroquinate synthase  60.85 
 
 		 359 aa  403  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  59.32 
 
 		 368 aa  404  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1840  3-dehydroquinate synthase  62.32 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.766033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  59.17 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1847  3-dehydroquinate synthase  62.89 
 
 		 357 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12558  3-dehydroquinate synthase  59.55 
 
 		 362 aa  389  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354876  normal  0.184174 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  58.82 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2354  3-dehydroquinate synthase  64.26 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2395  3-dehydroquinate synthase  64.26 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0139628  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2401  3-dehydroquinate synthase  64.26 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0377427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  58.06 
 
 		 519 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1307  3-dehydroquinate synthase  58.43 
 
 		 361 aa  364  2e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0261081 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  57.14 
 
 		 365 aa  363  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0878  3-dehydroquinate synthase  59.83 
 
 		 366 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3151  3-dehydroquinate synthase  59.21 
 
 		 353 aa  342  9e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  51.98 
 
 		 540 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  47.45 
 
 		 560 aa  329  5.0000000000000004e-89  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  48.03 
 
 		 593 aa  269  5e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  43.87 
 
 		 371 aa  238  1e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1131  3-dehydroquinate synthase  44.02 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  42.66 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  42.81 
 
 		 359 aa  233  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  38.76 
 
 		 363 aa  233  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  40.95 
 
 		 377 aa  231  2e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  40.51 
 
 		 366 aa  231  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  38.28 
 
 		 368 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 		 362 aa  229  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  39.89 
 
 		 372 aa  229  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  41.42 
 
 		 372 aa  229  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  39.09 
 
 		 363 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  36.03 
 
 		 368 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  38.31 
 
 		 370 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  40.72 
 
 		 370 aa  226  6e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2169  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 371 aa  225  8e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  40.29 
 
 		 369 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  39.18 
 
 		 373 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  37.54 
 
 		 364 aa  224  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  39.32 
 
 		 358 aa  224  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  41.23 
 
 		 363 aa  223  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  43.94 
 
 		 360 aa  222  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  44.17 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  40.63 
 
 		 367 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  39.61 
 
 		 370 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  40.55 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  37 
 
 		 345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  38.46 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  38.95 
 
 		 372 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  40.35 
 
 		 367 aa  219  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  39.04 
 
 		 388 aa  219  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  41.58 
 
 		 361 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0854  3-dehydroquinate synthase  38.15 
 
 		 346 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00901382  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  40.66 
 
 		 370 aa  216  5e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  40.48 
 
 		 368 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  39.33 
 
 		 359 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  39.33 
 
 		 359 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  39.33 
 
 		 359 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  39.33 
 
 		 359 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  39.33 
 
 		 359 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  39.33 
 
 		 359 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  39.33 
 
 		 359 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  38.84 
 
 		 361 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  38.92 
 
 		 361 aa  216  7e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  38.8 
 
 		 366 aa  216  7e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  39.04 
 
 		 359 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  39.04 
 
 		 359 aa  215  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  39.55 
 
 		 361 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  36.56 
 
 		 366 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  41.96 
 
 		 367 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  38.76 
 
 		 359 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  36.56 
 
 		 366 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  38.76 
 
 		 359 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  38.76 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  37.01 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  40.38 
 
 		 370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  39.04 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  37.39 
 
 		 362 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  38.55 
 
 		 361 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  36.93 
 
 		 366 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  40.44 
 
 		 367 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>